盱眙，建縣於秦。建縣前，盱眙為淮夷之地。周初，伯益的後代在今盱眙縣治北建立徐國，盱眙是其屬地。春秋時，盱眙名為“善道”，屬吳國。戰國時，越滅吳，盱眙屬越國；楚國東侵至泗上，盱眙改屬楚國。建縣以後，隸屬關系多次變更，盱眙先後隸屬過30多個郡、國、州、軍、路、府、省、道和地區，現屬江蘇省淮安市。
盱眙地處要沖。楚漢之際，楚懷王壹度在境內建都。西晉以後，臨淮郡、南兗州、北兗州、西楚州、招信軍和泗州等先後在盱眙設治。南北朝和南宋時期，盱眙曾升為郡、軍。
盱眙的境域，東晉以後曾有過多次變動，明、清兩代較穩定。民國期間，因析置嘉山縣等因，縣境縮小將近壹半。建國後，縣界也有三次變動。1985年，全縣(新區劃)面積2482．4平方公裏。
縣以下的行政區劃，明代實行鄉、圖制。清初沿襲，後期實行鄉、堡制。民國初期實行區、堡制，後來實行鄉、保、甲制。建國後，初期實行區、鄉制，鄉以下設村，1956年，村由高級農業生產合作社取代。1957年撤區並鄉。1958年人民公社化，政社合壹，公社以下為生產大隊和生產隊。 1983年政社分設，恢復鄉、村制。