農業部
農業部致力推廣永續農業和永續生活，以及提倡農作物本地產、本
地銷的基本理念。永續農業的生產示範
有機耕種，自1995年開始，嘉道理農場已在場內0.4公頃的山坡上進行有機耕作，種出超過50種蔬菜和香草。嘉道理農場有超過30年的梯田耕種經驗，場內大約17公頃的梯田辟作果園，種植了超過25種果樹。將經驗證有效的技巧引入生機園展覽，包括免掘耕種/護根方法、籃子堆肥、免掘耕種/籃子堆肥、花盆蚯蚓堆肥、方塊農圃、方塊苗圃、太陽能種子幹燥機等。
花盆蚯蚓堆肥，開發了三合壹蚯蚓堆肥及種植籃，將廚余放入容器進行蚯蚓堆肥，直接用作種植蔬菜或花卉的室內盆栽。
“果園復生計劃”，將采用單壹種植法的舊荔枝/龍眼果園改造為種植多種農作物的農林間作生境。
推廣具永續性的食物系統、健康食物及營養
香港有機農業協會，在1999年5月，嘉道理農場與本地其他7個有機農場創立了“香港有機農業協會”，協會肩負建立並協調香港有機耕作生產者和支持者的聯系及推廣和發展有機農作物市場。
有機農墟，2005年3月起，嘉道理農場每月首個星期日舉辦有機農墟。嘉道理
農場有機農墟及新界蔬菜產銷合作社有限責任聯合總社舉辦“太和農墟”，每月約有4個非政府組織及15個有機農場設置攤位，每次平均入場人次為1,500。教育部
致力提高大眾對人與環境關系的認識，透過保育和教育積極改善世界，推展多項為公眾和團體設計的活動。
農場博物館
於2006年慶祝金禧紀念設立展覽回顧嘉道理農場暨植物園的歷史。
接待嘉賓
嘉道理農場接待本港和海外訪客參觀。
於2006年著名靈長類動物學家珍古德博士（Dr. Jane Goodall）曾到訪參觀。
教育項目
教育部經常為不同年齡或團體舉辦多項活動，舉辦多類培訓課程及工作坊。
2007年植樹活動：於2005年開始在大帽山的山坡植樹。期間來自中學、專上學院、青少年組織、社區中心、慈善機構和專業團體等各界人士參與嘉道理農場的植樹計劃。
地理資訊系統日2006：參加者可透過實地研究、空中攝影分析和數碼制圖技術勘查和探遊嘉道理農場暨植物園的景貌變遷。
蝙蝠講座及工作坊：包括“蝙蝠講座及生態步行”及“晚間蝙蝠生態考察團”，為教育工作者提供富創意、珍貴而有趣的教學工具和資源，應用於課堂和戶外教育活動，挑戰
學生的思維，啟導學生多些關心大自然。動物保育部
動物保育部成立於1994年，最初稱為“動物保育及教育部”，項目包括野生動物拯救中心的獸醫院（由豬舍舊址更改建成）、設於猛禽護理中心的教育展覽、亞洲龜只保育繁殖計劃及與世界性野生動物保育組織的緊密合作。
野生動物拯救中心
是全港唯壹的野生動物拯救設施，自1994年開始香港政府便認許嘉道理農場進行拯救野生動物的工作，獸醫院專門治療受傷的野生動物，並盡力把康復的動物送歸原本的棲息地。拯救中心亦為香港政府委托照料被充公的動物，將珍稀動物轉介至設有保育繁殖設施的國際認可機構。拯救中心肩負下列四項使命：
接收本土物種，協助它們重新投入大自然。
充當暫時收容所。
支持人工繁殖計劃，保存物種基因源。
協助研究調查，提供珍貴的遺傳材料作分析研究。
2001年12月野生動物拯救中心接收了從馬來西亞偷運往中國野味市場作食用途中被香港政府截獲充公超過8,000只淡水龜，最後中心為約4,500只淡水龜在海外找到合適的居所。
保育工作
開展了壹項以保育為目標的亞洲淡水龜繁殖計劃，對象包括三線閉殼龜（Cuora trifasciata 俗稱金錢龜）。於2005年4月24日有賊人潛入偷去24只金錢龜。同年嘉道理農場在
外界顧問和漁農自然護理署職員協助下，於大埔滘自然護理區的溪流進行兩次捕龜行動，希望借此增加野生龜類的繁殖數字。香港的本地瀕危龜種包括金錢龜及平胸龜（Platysternon megacephalum），除此以外，亦進行香港鬥魚的保育繁殖計劃，並監察盧氏小樹蛙在嘉道理農場暨植物園內的遷地保育計劃。植物保育部
植物保育部於1994年成立，負責管理多個工作項目，均以植物保育為主，其中大部分亦兼顧繁殖工作。在園內不僅照料逾千個原生物種，更在香港及華南地區進行廣泛的野外考察。
園藝組
以前是專責美化和保養園內各大小園圃的部門，並入植物保育部，主力選用本土植物由其下的苗圃擔起培植的工作。是植物保育部的公關大使，既協助學校及其他組織處理園藝問題，亦負責設計展覽攤位，在香港花卉展覽、北區花鳥蟲魚展等場合中展出。
樹木保育及管理
致力加強與“國際樹木學會”（ISA）的合作，派員參加該會舉辦的研討會、正規培訓班和考察團，此外亦協助該會將 ISA《樹木攀爬者指南》的詞匯翻譯成中文。
協助民政事務總署保護著名的林村許願樹，包括提供指導及技術支援。
羅漢松保育，聯同水警及漁農自然護理署展開為期6個月的試驗研究，調查羅漢松（Podocarpus macrophyllus）種群在本港的分布現況，打擊非法砍伐和偷運羅漢松活動。
蘭花保育組
遷地繁殖珍稀瀕危蘭花是嘉道理農場植物保育工作其中壹個重要範疇，
利用無菌種子培養法繁殖本土蘭花。種子庫
收集植物的種子和進行萌發測試。
蝴蝶園
從管理蝴蝶園累積的豐富經驗，讓嘉道理農場可以透過提供意見、贈送蝴蝶幼蟲寄主植物及蜜源植物，與外界包括香港濕地公園、鳳園蝴蝶保護區、蒲窩環境資源中心及皇仁舊生會中學分享成果。
研究食品
嘉美雞
“嘉美雞”之命名源自“香港大學嘉道理農業研究所種及培養的美味雞”，現時市面上壹般雞只（如三黃雞）的皮下脂肪含量極高，肉質粗無雞味；有見及此，香港大學動物學系陳安教授於1996年開始於香港及國內搜羅十多種近乎原種雞（真正純種的雞已絕跡），用先進的遺傳工程技術將其純化，再交配出壹只品種優良的“嘉美雞”。