根據上述職責，市國土資源和規劃局設18個內設機構：
（壹）辦公室
（二）政治處
（三）信訪處
（四）政策法規處
（五）財務處
（六）規劃編制處
（七）重大項目處
（八）用地規劃處
（九）交通市政處
（十）耕地保護處
（十壹）征地處
（十二）土地利用處
（十三）拆遷管理辦公室
（十四）地籍處
（十五）建築與城市設計處
（十六）地質礦產處
（十七）測繪勘察處（市測繪局）
（十八）離退休幹部處
紀檢監察機構、機關黨委、工會按照章程和有關規定設置。