1.wash buffer中加入无水乙醇后，最终浓度大约相当于70%的乙醇溶液了，在沉淀的DNA中，由于过多的盐溶液存在，影响DNA的酶切等反应，wash buffer就是 洗去这些盐份的。
2.用无水乙醇沉淀DNA，这是实验中最常用的沉淀DNA的方法。乙醇的优点是任何都可以比和水相混溶，乙醇与 DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在，当加入乙醇时，乙醇会夺去DNA周围的水分子，使DNA失水而 容易聚合。一般实验中，是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混合，其乙醇的最终含量占67％左右。由此也可以改用95％的乙醇来替代无水乙醇（因为无水乙醇的） 价格大约比95％的乙醇昂贵）。但是增加95％的乙醇使总体积增加，而DNA在溶液中有一定程度的溶解，导致DNA损失也增加，尤其用多次乙醇沉淀时，就会 折中的做法是初次沉淀DNA时可用95％乙醇代替无水乙醇，最后的沉淀步骤要使用无水乙醇。也可以用0.6倍体积的异丙醇沉淀DNA。一般 在前面下放置15－30分钟即可。如果你没有加无水乙醇，则不能沉淀，都随洗液弃掉了。
3.十二烷基硫酸钠（sodium dodecylsulfate） 遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾（钾形成了十二烷基硫酸盐，PDS），钾离子取代了SDS中的钠离子了不溶性的PDS，而高浓度的盐，使得沉淀更完全。大家都知道SDS 专门喜欢和蛋白质结合，平均两个氨基酸上结合一个SDS分子，钾钠离子排列所产生的大量沉淀自然就会将蛋白质沉淀了，让人兴奋的是大肠杆菌的基因组DNA也一起被** *沉淀了。这个过程不难想象，因为基因组DNA太长了，长长的DNA自然很容易被PDS给***沉淀了，SDS虽然并不与DNA分子结合。
需要特别 说明是：预告的加入是为了中和NaOH，因为长时间的碱性条件会打断DNA，所以要中和之。基因组DNA一旦发生断裂，只要是50－100 kb大小的片断，就没有办法 再被PDS***沉淀了。所以碱处理的时间要短，而且不得剧烈震动，否则最后得到的队列上俱乐部有大量的基因组DNA混入。