目前關於海門島壹般有四種意見:海門島確實存在；海門島從未存在過；海門縣是海門島；利亞山島就是失落的海門島。1，載入史冊。海門島在許多歷史著作中都有記載:對海門島最早的記載是在宋代的藍芳瑜，”.....犯了死罪，獲得貸款的，更配去周沙門島，通州海門島……”；《明嘉靖四十壹年(1562)抗戰海圖編》中，標註海門島位於黃羊沙、天水港(今如東縣豐利鎮外)東北海域。明朝《萬歷通州年譜》(1577)記載:“海門島在州府(今南通市)東北海，宋朝所有罪犯都是罪有應得...今天它不在海裏。”以上記載表明，海門島在明朝萬歷年間之前確實存在。
2.有壹個區域概念。清代鹹豐年間通州人曹長恩在《東州偶然記》中描述:“海門島居東海，其形如傘如菇。人流的時候也叫君子洲。菇柄對著陸地，菇傘對著大海。手柄有14或5英裏長，但也可能有3或4英裏寬。傘最寬處八十裏，逐漸向海外伸展，收縮成穹形。”以上記錄顯示，海門島的島嶼面積還是比較大的。
3.有時間概念。據明代萬歷通州年譜(1577)“海門島在州東北海，……但現在不在海中”，而嘉靖海門郡年譜(1537)記載“海門島在縣轄北海”，卻沒有“不在海中”的記載，說明海門島在北海。1.所謂海門島，稱為“江海門湖口之島”，是長江口眾多古沙洲的統稱。宋末元初的文獻通考中記載，因死罪而批貸海門島時，有兩處去處——“海門島兩處，強難制者，轉崇明鎮，弱者，轉東洲鎮”。說明當時的海門島包括崇明鎮和東洲鎮。
2.只是壹些文獻中模糊的記載，並不能證明海門島真的存在。對於海門島的位置也是眾說紛紜。有人說在如東縣豐利鎮外，有人認為在呂四東北，有人認為在琴潭(呂四洞)以東，還有人幹脆說呂四就是海門島。關於清代曹長恩對待海門島的描述也不可信，因為海門島在清代是不存在的。
3.沒有任何地質證據或實物證據證明海門島的存在。牡蠣是近年來的熱點。有人認為這是消失了幾百年的海門島。但是歷史上記載的島嶼位置和範圍並不是很壹致，島上也沒有發現人類定居的痕跡，地質資料也沒有顯示這裏有綠洲的痕跡。
海門島，海門歷史之謎，希望更多人來解密。