南京，地處長江中下遊，歷史悠久，經濟發達，交通便利。是中國對外貿易和文化交流較早的地區之壹。因此，具有海關性質的關禁在南京由來已久。位於東晉至南宋、齊、梁、陳時期都城建康(今南京)的房山津和石頭津，是南京最早的具有輕微海關雛形的管理機構。他們負責征收關稅和檢查違禁物品，以及調查“叛徒”，即與“敵國”聯絡的逃犯。宋明時期，南京有外貿管理機構，如建康海關、龍江海關、大勝關等。他們專門征收船票和貨物稅。清代南京還增設了新絳關、新南津、西興關，主要是征收貨物稅，沿河檢查站也接受船單。
鹹豐三年(1853)，太平天國定都天津(今南京)後，設立了天津海關，這是中國歷史上第壹個由農民革命政權設立的海關機構。天海關成立後，實行獨立的海關政策，鼓勵正常貿易，實行輕稅政策，禁止鴉片進口，對促進生產，發展經濟起到了重要作用。同治三年(1864)，天京被清軍攻陷，天京關結束，只剩下12年。
海關主權是國家主權的重要組成部分。鴉片戰爭前，清政府設立的海關都是自己管理，關稅完全獨立。當時的關稅政策對增加中央財政收入、抵禦外國商品沖擊起到了壹定的作用。鴉片戰爭後，根據壹系列不平等條約，清政府被迫開放沿海和長江沿岸的通商口岸，帝國主義列強以清政府反腐為借口，插手海關事務。最後，英國人奪取了海關的最高領導職位——稅務總局。從此，海關管理、關稅自主和稅收控制的權力完全喪失。1899年，金陵海關開關，英國稅務總局局長赫德任命英國人安格連為金陵海關稅務司，這是南京歷史上第壹個由外國人控制的海關。金陵關建立時，清政府在金陵關設立了監察室，意在監督海關稅務部門，管理海關。但由於海關管理權實際上掌握在外國人手中，監管所形同虛設。這壹時期，金陵海關不僅實行了壹套西方海關管理制度，而且將稅率限制在“百分之五”的極低水平。同時還控制了南京港、航政、郵政的管理權，參與收集中國的政治經濟情報，成為資本主義列強對中國進行政治經濟侵略的重要工具。辛亥革命前，關稅作為債務和賠款的抵押，但仍由地方海關監管保管和繳納。民國元年，列強要求各地關稅全部轉到指定銀行。此後，金陵關稅全部轉移到英國商人在中國開設的匯豐銀行。海關自主權的喪失是中國陷入半殖民地半封建社會的重要標誌之壹，外國人管理海關也是近代半殖民地南京海關最重要的特征之壹。
民國26年，日本帝國主義發動全面侵華戰爭，戰火蔓延到江蘇，南京也在65438+年2月淪陷。初稅總司受英美控制，有特殊自立關系，故未隨國民政府撤至重慶，令金陵關退守漢口，後轉駐上海英租界江海關。至此，金陵關海關活動暫停。民國30年，太平洋戰爭爆發後，海關管理權落入日寇手中，轉移到上海的金陵海關完全受制於日本稅務部門。民國31年，日偽政府成立南京轉口稅征收署，次年升級為海關轉口稅征收署南京總署，管轄蕪湖分署。這壹時期征收處的主要負責人都是日本官員，所以占領區的海關已經變成了殖民海關。抗日戰爭勝利後，由於對外貿易銳減，江蘇只恢復了金陵關和連雲港關隘。
中華人民共和國成立後，帝國主義、封建主義和官僚資本主義在中國的統治結束，中央政府收回了海關的行政權和關稅自主權，建立了獨立的社會主義人民海關。1949南京解放後，人民政府接管金陵關。次年，由於帝國主義的經濟封鎖，南京海關業務減少，金陵海關被海關總署命令撤銷。此後，南京海關業務壹直中斷。
1978年底，中國* * *產黨召開十壹屆三中全會，確定國家以經濟建設為中心，實行對外開放政策。江蘇省的對外貿易、對外友好交往和旅遊業發展迅速。由於建國後南京沒有通關，所有海關業務都要在外地辦理，或者由外地海關派人到南京，難以適應和滿足江蘇省對外開放的需要。所以在南京設關的聲音越來越大。1978年9月23日，國務院批準在南京設立海關。
1979 65438+10月1，南京海關正式開關。南京海關最開始是處級海關，下設四個部門，隸屬於江蘇省外貿局。當時海關業務單壹，主要是征收進出口貨物關稅，辦理旅客行李物品的驗放手續。開關第壹年，* * *征收關稅和進口環節稅9475元，放行進口貨物28.4萬噸，辦理旅客行李物品3345件。
1980年，海關建制劃歸中央，實行垂直領導體制。南京海關直屬海關總署領導，1984升級為局級海關。
20世紀80年代以後，隨著江蘇省外向型經濟的蓬勃發展，南京海關進入了壹個全面快速發展的歷史階段，轄區從南京1口岸擴大到全省10口岸。在此期間，南京海關還啟動了保稅和查驗服務，航空、鐵路、公路和長江支線船舶中轉服務，郵政貨物監管服務，並加強了知識產權邊境保護、反傾銷和反補貼、環境保護、防止武器擴散和港口規劃等新職能。截至1999年底，南京海關共有副局級海關2個，局長級海關30個，副局級、局長級機構18個，海關人員1800人。至此，南京海關基本形成了由總關、隸屬關、辦事處組成的布局合理、層次分明的海關管理機構體系，基本適應了南京及江蘇省多層次開放區域、海陸空郵等運輸方式、壹般貿易和多種靈活貿易方式的監管需要。綜合業務量進入全國海關前10，成為海關系統的標誌。1999年征收關稅、進口稅11599萬元，監管進出境貨物3594300噸，查驗放行旅客行李物品193903件。
成立20年來，南京海關認真貫徹“促進先行”的工作方針，堅持為改革開放、經濟建設和深化業務改革服務，通過嚴格依法行政，為促進外貿發展、維護正常進出口秩序做出了積極努力。1993 10，壹批化學廢物從韓國運抵南京，被南京新生圩海關在上元門碼頭查獲。這是建國以來中國海關查獲的第壹起走私進口洋垃圾案件。這壹案件引起了國家的高度重視，通過外交途徑被遣返回國。因此，南京新生圩海關受到了國家環保局和海關總署的通報表揚。此後，海關的環保職能得到加強。在隊伍建設和隊伍管理方面，南京海關貫徹“從嚴治關”方針，積極開展消除執法腐敗、創建文明窗口和行業活動。到1999，南京市已有7個壹線崗位被授予“青年文明號”和“文明之窗”。南京海關還積極推動建立現代海關制度，加大業務改革力度，運用科技手段加強對進出口貨物的監管，打擊騙匯騙稅等違法犯罪活動。1998 10，南京海關實施通關作業改革，采用H883/EDI自動報關系統，實現關區內計算機聯網、單證集中查驗，極大方便了進出口企業。新的通關作業模式已經與國際慣例接軌。
1999 65438+10月8日，南京海關走私犯罪偵查分局正式成立。組建緝私警察部隊是黨中央、國務院改革中國緝私體制的壹項重要決策。緝私警察部隊專門打擊走私犯罪，具有刑事執法權，實行海關總署和公安部管理體制，以海關總署為主體。南京海關走私犯罪偵查分局成立後，在打擊走私犯罪方面發揮了重要作用。6月19965438+10月至2月65438+2月，立案偵查走私案件24起，抓獲走私犯罪嫌疑人54人，經檢察院批準逮捕28人。