春秋戰國時期，疆域先屬吳越，後屬楚。
春秋末年，屬吳。吳滅後，歸越國。周鎮定二十四年(公元前445年)，楚國多次入侵泗水流域，淮陰歸楚國，最終歸楚國。
秦王二十四年(前223年)設淮陰郡，屬泗水郡(東海郡，又稱譚郡)，淮陰郡位於甘洛城(今碼頭鎮東北壹裏，相傳為秦尚卿甘洛所建)。
西漢初，涪陵縣位於淮陰縣西南(今洪澤湖及洪澤、盱眙部分地區)。漢高祖六年(201)，韓信封為淮陰侯，淮陰為其封地。十壹年，韓信被殺，淮陰後國被取消，仍稱淮陰郡。武元帝開國六年(前117)，設臨淮郡，淮陰、涪陵為其郡。
王莽篡漢，改淮陰為嘉信，改臨淮郡為胡愛萍郡。
東漢初，臨淮郡入東海郡，淮陰郡屬之，涪陵郡撤，其地入淮陰郡。永平十五年(公元72年)，在故裏臨淮縣建立邳國。建安十壹年(2006年)，下邳名廢，仍屬臨淮郡、淮陰。
在三國時期，它屬於魏和魏韓成，沒有改變。
金武帝初，仍屬臨淮郡。太康三年(282年)遷廣靈郡治淮陰，遷晉帝渡河、廣靈郡，共三十四年。
東晉永和八年(352)，徐州，浚縣以北中郎將，鎮守淮陰。
南朝三年(467)，淮河以北被北朝占領。淮陰，劉崧駐兗州鎮，七年(471)，改稱北兗州。小琪建元四年(482)，兗州鎮遷址。永明七年(489)，淮陰復置東平郡，統領壽章、淮安兩縣。
梁改淮州，郡治淮陰，郡改稱淮恩。太清三年(549)，侯景以小為北兗州刺史，但州民不肯出兵，故淮陰又稱為北兗州。侯景派大將羊海幫助小，羊海帶向東魏投降。東魏位於淮陰，仍稱懷恩縣、淮州縣。
陳太鑒九年(577年初)，恢復壽張之名。東平郡將重新建立。
隋朝初恢復淮陰縣，不久淮陰縣被廢。大業初(605年)，淮陰設在楊珊(今淮安區)，楊珊從此合並淮陰。
唐武德初年，恢復淮陰郡。武德七年(624)，淮陰第二次並入山陽郡；乾封二年(667)，淮陰從楊珊劃出，恢復郡。
五代至北宋，仍稱淮陰縣。
南宋建炎元年(1127)，武城縣位於淮陰縣西部，三年後歸淮陰縣。紹興五年(1135)，廢郡為鎮；過了壹年，就成了壹個縣。南宋鹹淳九年(1273)，在淮陰老城以北、泗水入淮口(即古泗口，又名大河口)設立清河郡，清河郡名由此開始。
元初清河、淮陰、忻城三縣並置，清河軍廢，縣屬淮安道誌署。至元二十年(1283)，淮陰入楊珊，故淮陰四進楊珊，清河因建立較晚而單獨存在。泰元年(1324)，黃河決口，大青口縣城被毀，郡尹沒花時間就把清河郡遷到甘洛城。清河開始到淮陰老家，縣域在淮水南部。
明初，清河郡還在小青口(今碼頭舊縣)西北，直到崇禎元年(1628)，因為水患和戰亂，又遷到甘洛城。
清順治三年(1646)，清河縣仍移至小青口(今碼頭舊縣)西北，屬淮安府。康熙中期，縣城屢遭水淹。乾隆二十六年(1761)，江蘇巡撫陳鴻謀於次年請求遷至楊珊清江浦，清江浦附近十余鄉並入清河。清江浦成為清河縣新的縣政府，除南部的唐靜(今譙周)和青州澗(今聚義河)外，仍屬。
民國初撤銷淮安府，縣直屬江蘇省。民國三年(1914)，清河縣改名為淮陰縣(因此與河北省清河縣同名)。還是位於清江浦。並在此設立淮陽守備衙門和淮陽易道衙門，以淮陰為縣。民國十六年(1927)撤路，民國二十壹年(1932)在清江浦設立淮陰行政督察署，淮陰縣歸其管轄。民國二十六年(1937)年底，日軍入侵江南，江蘇省政府遷至此。民國三十四年(1945)八月，抗日戰爭勝利。9月，新四軍解放淮陰市，簡稱清江浦，建立清江城，農村仍為淮陰縣。
1948 12、淮陰市被解放軍解放，市區和淮安合並為淮北市，市政府駐清江浦。淮陰縣是農村。1951年1月，縣城從淮陰縣劃出，列為清江市，淮陰縣政府遷至王瑩鎮。
1958年8月，清江市與淮陰縣再次合並，組成淮陰市。1964 10，市縣又分為淮陰縣和清江市，均屬淮陰專員公署。1983年3月，江蘇省實行市管縣體制，撤銷淮陰區專員公署，設立淮陰市。同時，清江城以李運河為界分為清河區和青浦區。
2001 1 1，淮陰市更名為淮安市，隸屬清河區，轄區不變。