在他的領導下，紅軍分為左右兩軍。左路軍由紅軍總指揮部(總司令朱德、總政委張、參謀長劉伯承)領導，右路軍由紅軍前方敵指揮部(總司令許、政委陳昌浩、參謀長葉劍英)領導。
毛爾蓋會議確立以右路軍為主力打通北通道，左路軍靠近右路軍。但張仍堅持南下，同時不斷為前敵指揮部發電，試圖使南下之利，北上之弊。
右路軍政委陳昌浩在毛爾蓋會議上也同意北上，但後來在張電報的影響下改變了主意。
陳昌浩是鄂豫皖川陜蘇區“三駕馬車”(張、陳、徐)之壹。他在歷史上做出了重要的貢獻，但是他的壹個特點或者說缺點也是非常明顯的:猶豫不決，膽小怕事，缺乏主見。這壹缺點不僅是紅軍“分裂”的壹大原因，也是後來西路軍失敗的重要原因。
陳昌浩改變主意，同意南下。總司令許改變了主意，因為他不想看到紅軍分裂。
許帥在回憶錄中回憶說，陳昌浩改變主意後，X親自到他的住處征求意見，實際上是讓他表態。許帥回答說:“既然兩軍相遇，就不宜分開。四方面軍分成兩半，恐怕不好。”x“看到我的態度，也沒說別的，叫我早點睡。”
正是這個決定，讓許帥“後悔終生”
由於陳昌浩和許都同意南下，中央決定由紅1和3軍團單獨北上。他們趁著夜色偷偷行進，沒有通知陳、徐等人。第二天，下面的人趕來報告，葉劍英參謀長失蹤了，中央紅軍連夜離開了。
壹時間，整個前敵指揮部壹片茫然和迷茫的氣氛。許帥“驚呆了，坐在床板上，半個小時說不出話來。”
這時前方打來電話，說中央紅軍走了，但也有人警告他們，問他們要不要打。對於這個顯而易見的答案，陳昌浩又猶豫了。最後，他詢問了許帥的意見。許帥說:“紅軍怎麽打紅軍？”反正不能打！"
許帥態度堅決，陳昌浩見狀也同意了許帥的決定，避免了壹場悲劇。
中央紅軍獨自北上，這對許帥是壹個很大的打擊。所以他“忍不住偷偷哭”，甚至動了“帶個警衛，騎到中央後”的念頭。
據說，這些年他與張、陳的合作並不愉快，時有分歧和爭吵。許帥坦言，陳昌浩在軍中威望很高。他不點頭，就動不了隊伍。況且他是看著紅四方面軍從小到大發展起來的。“我很難接受被分成兩半並分道揚鑣，無論是在智力上還是情感上。”許帥說，“這可能是我的弱點……”
壹、四方面軍會師前，許帥同意北上方針。然而，由於自身的困難和誠實的性格，許帥未能為此而努力，甚至“犯下了終身羞愧的錯誤”
許帥晚年反思此事時寫道:“由於我當時水平不高，沒有站在原則和戰略的高度看問題。”我希望中央能說服張。“如果實在不行，我寧願等，不然就要壹起南下了。”“結果摔了。”
許帥的反思是真誠和深刻的，我們不應該過於苛刻。
他留下後，與朱先生、劉帥等同誌團結壹致，對紅四方面軍最後的北移起到了重要的推動作用。而且部隊南下既然已經成為不可挽回的既定事實，即使不認同張的割據，也要盡力為部隊尋找生機，充分發揮其指揮作用，這也是愛護紅軍的壹種表現。
紅四方面軍和部分紅軍同誌南下後，遭受了壹系列犧牲，尤其是百丈之戰，損失近萬人。再加上那年冬天天氣異常寒冷，下了十年壹遇的大雪，給部隊造成了不小的損失，補給也越來越困難。結果，人們越來越意識到南向路線的錯誤。
這時，(林玉英)帶著共產國際的指示從蘇聯回來了，於是張成了“孤家寡人”，最後被迫同意北上陜甘。
在去北方的路上，張曾當眾流下眼淚，說“我要死了。我要去陜北坐牢……”。可見張知道是有罪的。
而陳昌浩也因此背上了沈重的思想包袱，導致陳昌浩在指揮西路軍時更加猶豫不決。為了“洗白自己，從壹個極端跳到另壹個極端”，即從支持張分裂的極端跳到壹切重要、盲從、請示、膽怯的極端。遇到事情，我只聽命令，但絕不會獨斷專行，也不願意承擔任何責任。
應該說，西路軍壹次次喪失寶貴的機會，最後幾乎全軍覆沒，陳昌浩同誌難辭其咎。
西路軍失敗後，陳昌浩和許帥壹起回到延安。途中，他遇到壹個老鄉，決定“多休息幾天再走”。許帥獨自踏上了歸途，壹路上歷盡艱難困苦，終於回到了延安。即使路途艱難，許帥依然保留著組織給他的路費(十幾個金戒指)，拒絕隨便花。他堅毅的性格令人感動。
到達延安後，張聞天同誌嚴厲批評了許帥，但許帥沒有說話。他覺得既然被標記的軍隊打了敗仗，“就應該批評、撤職、斬首”。但X安慰他:“留得青山在，不怕沒柴燒。哪裏有雞，哪裏就有蛋。”這感動了許帥。
另壹方面，陳昌浩在老家病重，後又回到湖北老家休養。直到抗日戰爭爆發後的壹段時間，他才回到延安。