南方醫院神經外科成立於1958，是國內較早的神經外科單位。首任主任李教授是中國最早的神經外科專家之壹，是中國第壹個神經外科專家組成員。1965年成功實施大腦半球切除術治療腦膠質瘤，並為此榮立三等功。到1979，該科已能開展脊髓造影、腦室造影、氣腦造影和選擇性腦血管造影，還能開展鈦板顱骨修補術、腦積水分流術、幕上及下開顱術、腦腫瘤切除術、脊髓腫瘤手術及各種顱腦損傷手術。1979年已經開始在全國招聘高級醫生，1980年已經陸續開展了鞍區、後顱窩、橋小腦角、顱內動脈瘤、腦動靜脈畸形等各種腫瘤的手術治療，但病例數量較少，1979-1985。在動物實驗的基礎上，缺血性腦血管病、顱內外動脈搭橋術、顳肌應用開展較多。1981-1982開始立體定向手術，手術治療脊髓空洞癥、顱腔狹窄、扭轉痙攣、痙攣性斜頸。1980-1983年陳景賢教授進行丘腦腫瘤切除術(10以上)1984年引進應用神經外科專用手術顯微鏡(日本產)，1984年成為全省首家招收神經外科研究生的單位(導師為李教授，第壹屆研究生為)。1985南方醫院引進國內第壹臺磁共振(MR)設備，首次應用於神經外科。
65438-0989任文德教授任科主任後，顯微外科技術逐步普及和提高，主要開展顱內動脈瘤、動靜脈畸形、聽神經瘤和壹些復雜顱底腦膜瘤的手術。1990後手術了松果體區和腦幹腫瘤，但例數較少。同時進行後顱窩及微血管減壓術治療三叉神經疾病。從1991開始，該科在全省首次開展皮層腦電圖監測下癲癇病竈切除術(治療頑固性癲癇)。1991科室引進OPTON(歐波童)手術顯微鏡和CUSA，1994引進X刀。南方醫院神經外科成為國內最早開展立體定向反射手術的單位之壹。1995引入微電極導向立體定向手術(細胞刀技術)，1996 -1998引入神經外科專用手術臺、snake牌等高速電鉆、蔡司平衡顯微鏡。
65438-0998年，齊松濤教授任系主任後，科室規模不斷擴大，業務技術全面發展，學科特色進壹步明顯，技術水平明顯提高。經過近40年的建設，到2000年，南方醫院神經外科已成為集醫療、教學、科研為壹體的大型神經外科中心，年手術量1500，臨床床位65438張。其中，獨立專科ICU病房是中國及華南地區規模最大、功能最全的神經外科單位之壹，可開展幾乎所有神經外科疾病的現代化治療，在醫療技術、設備、手術成功率等方面均達到國內外先進水平，是華南地區手術量最大的神經外科。20年來，從全國招聘了200多名高級醫生，56%的患者來自廣東省，其余來自全國各地，包括港澳臺和東南亞。