明洪武二年(1369)，設立廣東省廣州府，轄南海、番禺兩縣，芳村地區屬南海、番禺兩縣管轄。即花地河以東，下坊村、白鶴洞屬番禺縣；花地河以西的石圍塘、修水、海北、海中、海南屬於南海縣。
10年(1921)，廣州成立。市政廳有公安局，公安局有區局和分局。芳村花田分公安分局，芳村部分區域首次直接納入廣州警方轄區。
民國二十六年(1937)七月，原屬番禺縣蛟塘公司管轄的崇文社鄉(即崇文二十四鄉)劃歸廣州。與民國二十年廣州公布的“權宜區”相比，有所擴大，壹般包括芳村區花地河以東地區。民國35年，原屬南海縣管轄的葵蓬、楓溪、西樵劃歸廣州。民國36年，廣州市政府將市區劃分為28個行政區，芳村區設立芳村、崇文兩個區公所。
1949 165438+10月15。* * *廣州市委、市人民政府決定，將芳村區辦事處和崇文區辦事處合並，組建芳村區人民政府。自此，芳村首次設立區級政權，直屬廣州。
1954年6月，芳村區撤銷，下轄山村、芳村、花地、湧湧口4個鎮劃入河南區(現海珠區；沙湧、河東、董嬌、西樵、南郊、董嬌、茶角、奎蓬等8個鄉鎮納入新郊區。1959年4月，龍溪、海北、海中、海南、增蛟、修水由南海縣劃歸廣州市，並入郊區河東公社(新蛟區已撤銷)。至此，金芳村所轄區域全部劃入廣州。
5月23日，1960，芳村人民公社成立。同年7月6日，芳村人民公社改為芳村區，隸屬廣州市。1961年11月荔灣區石井、海珠區新洲、新豐、新滘、越秀區三元裏、嘉禾、桂龍等7個人民公社劃入芳村區。
1962年5月，芳村區再次撤銷，芳村區劃歸廣州郊區管轄。
1985 165438+10月2日，芳村區第壹屆人民代表大會常務委員會和區政府領導成員選舉產生，第三區建設順利完成。按照市規定，中共中央、區人大、區政府、區政協、中共中央紀律檢查委員會的屆次從零開始計算。下轄河東區辦事處和芳村、白鶴洞兩個街道辦事處。河東區辦事處設在南郊、沙羅、河東、坑口、董嬌、茶角、花地、山村、葵蓬、五眼橋、海中、海南、海北、龍溪、增角、西浜、東浜。1987 65438+10月，撤銷河東區辦事處，成立董嬌鎮人民政府。同時，芳村街道、白鶴洞街道調整為花地、白鶴洞、沖口、石圍塘街道辦事處。
1990年末，上述4個街道有1個鎮，全區有38個居委會(含家屬委員會)，17個村民委員會。38個居委會分別是:海龍、西樵、茶滘、董嬌、雲水(董嬌鎮以上)和興園、山村、陜西、山嵐、火車站、南塘、秀水、塞壩口(石圍塘街以上)、宋河、墩頭、興化。17村民委員會分別是:龍溪、葵蓬、南郊、西堡、海南、茶角、東沙、沙羅、東堡、增角、海中、坑口、海北(以上隸屬東堡鎮)和。