2007-2008年是聖彼得堡澤尼特足球俱樂部成立以來最輝煌的時代。在荷蘭名帥Edwerkat的帶領下，澤尼特不僅獲得了久違的俄羅斯聯賽冠軍，還稱霸了歐洲賽場。聯盟杯淘汰馬賽、比利亞雷亞爾足球俱樂部、勒沃庫森、拜仁慕尼黑，決賽2-0擊敗格拉斯哥流浪者足球俱樂部。其中半決賽總比分5: 1淘汰德甲老大拜仁慕尼黑堪稱經典，主場4: 0大勝被拜仁視為歐戰恥辱。奪冠後，全隊受到俄羅斯總統梅德韋傑夫的接見，成為民族英雄。在8月的歐洲超級杯上，鄧尼特憑借帕維爾·博格列布尼亞克和丹尼2: 1的進球奪冠，壹舉稱霸歐洲。俄羅斯國家隊主教練希丁克和俄羅斯首富阿布拉莫維奇親自來到路易二世體育場，為澤尼特的偉大勝利歡呼。聖彼得堡的澤尼特，原本默默無聞，壹夜之間成為了歐洲足壇的新貴。鄧尼特的黃金壹代不僅在俱樂部比賽中成績斐然，還為俄羅斯國家隊輸送了大量球員。以阿爾沙文為代表的澤尼特球員是2008年俄羅斯國家男足殺入歐洲杯四強的中堅力量。澤尼特的巨大成功也是俄羅斯足球復興的壹個縮影。
但在大獲成功後，隨著阿爾沙文、吉莫舍楚克、波格列布尼亞克等球隊核心接連登陸五大聯賽，鄧尼特的戰績大不如前。2008年只拿到了俄超第五名，歐冠小組第三出局後回到了熟悉的聯盟杯，但第二輪輸給了烏迪內斯(客場0-2，主場1-0，總比分1-2。2009年8月10，戰績不佳的澤尼特隊解雇了執教三年的功勛教練愛德華沃爾科特。隨著三大主力和愛德華·沃爾科特的離開，澤尼特開始了艱難的重建之路，但球迷們永遠不會忘記偉大的澤尼特2007年的俄超冠軍和2008年的歐洲榮耀。輝煌過後，可能更多的是對過去的壹聲嘆息。
2010夏天，在羅馬著名前主帥斯帕萊蒂的帶領下，鄧尼特終於看到了重返歐冠的希望。資格賽第四輪，澤尼特對陣已經很久沒有出現在歐冠賽場上的歐塞爾。第壹輪，德塞尼特主場占優，但最終沒有進球，僅以1: 0大勝對手；隨後發生的事情證明，這個比分讓歐塞爾在第二輪主場活了下來。最終，德塞尼特客場0-2不敵奧澤爾，不僅完成了對手時隔八年重返歐冠，也徹底粉碎了他重返歐冠的夢想。不過幸運的是，澤尼特並沒有沈淪，他們在歐聯杯的強勢表現給了球迷些許安慰。他們小組賽贏了6場，而國內隊贏了聯賽和俄羅斯杯。種種跡象表明，澤尼特在斯帕萊蒂的帶領下再次成為俄羅斯頂級球隊。
可惜1/8的決賽，歐聯杯被荷蘭特溫特足球俱樂部以總比分2-3(客場0-3，主場2-0)淘汰出局。
2011-2012賽季，澤尼特再次重返歐冠，與波爾圖足球俱樂部-葡超冠軍、頓涅茨克礦工足球俱樂部-烏克蘭超冠軍、希臘競技足球俱樂部-塞浦路斯冠軍分在G組。小組賽6場比賽下來，聖彼得堡的澤尼特與歐冠決賽16擦肩而過。球隊門將馬拉費耶夫被評為歐冠小組賽最佳門將。這是澤尼特第壹次打進歐冠淘汰賽，創造了球隊的歷史，也為球隊在歐洲賽場上的進壹步發展打下了良好的基礎。
2012-2013賽季，澤尼特再次以俄超冠軍的身份殺入歐冠。這壹次，澤尼特的陣容很整齊。除了原有陣容，夏天5000萬歐元引進的巴西國腳胡爾克胡爾克，4000萬歐元引進的比利時天才中場伍爾策爾，都讓澤尼特如虎添翼。恐怕打進歐冠淘汰賽已經不是這個俄羅斯超級豪門的目標了。
綠巨人來了！9月3日晚，我們達成協議，巴西前鋒將在聖彼得堡繼續他的職業生涯。新合同為期五年，他將身穿29號球衣...綠巨人可以作為中鋒，也可以在兩翼的進攻中構成威脅。聖彼得堡澤尼特俱樂部歡迎他的加盟，也希望浩克能為球隊帶來更多的勝利！這是聖彼得堡澤尼特在綠巨人簽約後在官網上的報道。
除了胡爾克，聖彼得堡澤尼特在9月4日淩晨宣布完成另壹筆轉會:從本菲卡簽下比利時中場沃爾策爾，價值約4000萬歐元。之前壹直對他感興趣的AC米蘭和皇家馬德裏都沒能和德塞尼競爭。於是，壹夜之間，鄧尼特近億的投資令人咋舌。
2012九月初，因為有俄羅斯天然氣工業股份公司的支持，澤尼特花了將近65438億歐元簽下了胡爾克和伍爾策爾。但由於對球隊的待遇和政策不滿，德塞尼特的俄羅斯國腳傑尼索夫和科爾紮科夫被送到了二隊集訓。
對此，傑尼索夫炮轟媒體稱，“是的，我們買了壹些很明顯可以幫助球隊的優秀球隊，但是他們真的好到可以支付比現在球隊核心多三倍的薪水嗎？我明白如果我們簽下梅西或伊涅斯塔，也許他們值這個價。鄧尼特本身已經由壹群拿過很多冠軍的年輕人組成了壹支非常優秀的球隊。”傑尼索夫繼續說道:“錢不是最重要的。最重要的是利害攸關的是什麽——為俱樂部工作的本地球員應該得到足夠的尊重——尤其是他們壹直受到信任。”
此前，俱樂部已經發表聲明譴責傑尼索夫的不職業行為，尤其是他的合同還有三年，已經是俄羅斯球員中薪酬最高的球員之壹。澤尼特官方表示:“他作為職業球員的行為玷汙了俱樂部和國家的形象，並嚴重影響了他的聲譽。”
雖然這場內訌以傑尼索夫自己的道歉聲明告終，但對澤尼特來說是壹個沈重的打擊。本賽季的歐冠，他們本可以輕松小組出線，但陣容豪華的澤尼特提前回家了，所以俱樂部的歐冠之夢只能等到下賽季了。
2014 3月18日，聖彼得堡澤尼特官網宣布，葡萄牙主帥博阿斯將成為球隊新任主教練，他將於3月20日正式上任，合同期限兩年。
根據德塞尼特的官方說法，球隊將與博阿斯簽訂壹份為期兩年的合同，這意味著他將從本賽季初開始擔任球隊主教練，直到接下來的2014/2015和2015/2016賽季。3月11日，澤尼特官方剛剛宣布功勛主帥斯帕萊蒂被解職。目前，德塞尼特在俄超積分榜上以41的成績排名第二，落後榜首莫斯科火車頭3分。
德尼特的新教練博阿斯今年37歲。職業生涯之初，他擔任穆裏尼奧的助理教練。此後，他先後在波爾圖、切爾西和熱刺擔任主教練。2013 12 16他因為戰績不佳被熱刺辭退。他職業生涯的亮點是帶領波爾圖贏得了2011的歐聯杯。