在義和團運動的積極排擠下，外國人被稱為“大俄國人”，將被殺無赦。如果中國人信仰天主教和基督教，壹般被稱為“二毛”；其他懂外語甚至用洋貨的人，被稱為“三毛”或“十毛”，從被侮辱、被搶劫到被打死不等。人們記錄道:“如果使用香煙、眼鏡，甚至雨傘和襪子，使用者將被處死。有六個學生匆忙逃離混亂。因為他們隨身帶了壹支鉛筆和壹張外國紙，途中被土匪發現，都死了。羅星使的弟弟西祿，從河南到天津，帶了兩箱洋書。他不忍心放棄他的愛情。他的去路被土匪綁在壹棵樹上，土匪的刀極其鈍，無法轉身，他仰望天空，樂在其中。壹個仆人多年相談甚歡，主人不是兩毛錢，卻也被打死了，唯壹的馬夫幸免於難。它討厭外國的東西。甚至還有“壹家有火柴，八個人壹起打死。"
據統計，1900年夏天有241名外國人(天主教傳教士53人，新教傳教士188人及其子女，其中包括53名兒童)和20000多名中國基督徒(天主教徒18000人，新教徒5000人)被義和團屠殺。
在山西，據說全省有5700多名中國天主教徒和數千名新教徒被殺，其中大陸教會最大，其他還有公理會和英國浸信會。7月9日，在太原總督府衙門前，於賢總督殺害天主教方濟各會傳教士12人(意大利主教艾世傑、富格拉，3名神父、修士、7名修女)，新教傳教士及其家屬子女34人(隸屬英國浸信會、壽陽會，其中子女11人)，共計46人。山西是和平居民仇殺外國人最多的省份。
在內蒙古，19年7月，清軍騎兵侵占了蒙古西南主教大教堂所在的24公頃土地，村裏的天主教徒大量被殺。比利時人韓默理主教被“手拉手，用竹竿捆著”，然後“把壹根鐵索穿過肩胛骨，囚禁在籠子裏”，遊街示眾。7月24日，他在托克托市被殺。蒙古東部教區，神父被活埋在灤平縣。蒙古中部大部分教區(3200多人)被殺，只有5000多名教區居民在西灣子(河北崇禮)聖公會避難。
在直隸(河北)，義和團在巡撫尤魯和錢廷鏞的支持下，遍布全省各縣。這個省(至今仍是中國天主教徒最集中的省份)的大量天主教徒突然面臨死亡的威脅，在各地天主教徒聚集的村莊修建堡壘。7月20日，陳率領的清軍攻入荊州朱家河村，聚集在村裏的3000多名天主教徒和兩名牧師，不分男女老幼，對他們進行屠殺，是1900年中壹次性死亡人數最多的壹次屠殺。朱家河50575名信眾中，5153人死亡，只有獻縣張莊耶穌聖心大教堂幸存。保定附近的東魯村聚集了9000名天主教徒在此避難。因為擊退了四萬義和團的進攻，這裏成為北方著名的聖母院朝聖地，也是戰後中國天主教徒最集中的村莊。
奉天(遼寧)天主教徒被殺1400余人，其中主教1人，牧師10人。
在浙江曲臺，也發生了大屠殺。在湖南衡州和陜西省，主教和牧師也被殺害。在山東和河南，78%的教堂被毀。