東晉隆安孫恩起義三年(399年)十月至元興元年(402年)三月，孫恩帶領浙東人民抵抗東晉農民起義戰爭。淝水之戰後，東晉外部威脅暫時消除，孝武帝滿足局部安全形勢，攝政王會執掌王司馬專制大權，政刑混亂，朝中多方，政事腐敗，流血鬥爭不斷爆發。浙東的賦稅很重。新安知府五鬥米道的創始人孫泰，企圖用傳教的方式聚眾反抗東晉朝廷，被司馬道子陷害而死。其侄兒恩逃到翁州島(今浙江舟山群島)，糾集百余人伺機報復。隆安三年十月，孫恩利用朝廷強征“樂書”(晉朝在浙東各縣征免奴隸服兵役)，引起浙東社會動蕩，登陸攻克上虞(今浙江)，攻打會稽(治殷珊，今浙江紹興)；十壹月，會稽文官王凝之被俘，自稱東方將軍，被殺。當時惠濟、吳軍、吳興、宜興、臨海、永嘉、東陽、新安等八郡(今江浙)相繼響應，十幾天之間起義軍發展到數十萬。晉朝廷命魏將軍、輔國將軍率領北府兵鎮壓，義軍於十二月大敗，退回本島。四年(400年)五月，孫恩在綏口(今浙江鎮海東南邕江入海口)登陸，攻克余姚(今浙江)和上虞，隨後進攻興浦(今浙江紹興東)和會稽，轉戰臨海，與金軍激戰。十壹月，晉寧朔將軍高衙內戰敗，孫恩軍追到殷珊。當東晉遭遇大地震時，劉牢之奉命指揮北府兵和浙東五郡的士兵對起義軍進行反擊。孫恩避其鋒芒，然後退入島內。五年二月，孫恩帶水軍攻句容(今浙江江南岸南音)。回到島上。三月，攻至海鹽(今浙江)，敗於武帝。五月轉攻湖都(今上海吳淞江)，沿江西進。六月，到達京口(今江蘇鎮江)，逼近建康(今南京)。東晉朝廷緊急抽調江北各郡的忠臣和浙東劉牢之的北府兵保衛首都。孫恩害怕了，暫時放棄了攻打建康的計劃。壹方面派兵到江北重鎮廣陵，攻下(今江蘇揚州西北)，另壹方面孫恩親自率領主力浮上海北，攻占豫州(今江蘇連雲港市董允臺山，當時在海中)，高衙內卻被活捉。八月，起義軍與劉裕率領的金軍激戰，孫恩再次失利，損失慘重。他被迫沿著海岸向南撤退，第四次撤到島上。元興元年(402年)三月，起義軍進攻沿海遭到嚴重挫敗。孫恩失去信心，投水自盡。他的家人和下屬跟著淹死的100多人。許多幹部推舉他們的妹夫魯迅為領袖，繼續與金作戰(見魯迅起義)。
魯迅起義東晉元興元年(402)至藝兮七年(411)，魯迅領導了壹場反抗東晉的農民起義戰爭。孫恩的妹夫魯迅，參加過孫恩起義(見孫恩起義)。元興元年三月，孫恩跳海自殺後，魯迅率領數千義軍繼續鬥爭。桓玄攻下建康，執掌東晉後，為了安撫浙東，便起用魯迅為永嘉太守。盧表面上受命，暗地裏擴張勢力。五月，魯迅進東陽(今浙江金華)，被劉裕擊敗(見劉裕對桓玄之戰)。元興二年，魯迅派徐道富攻東陽、永嘉(今浙江溫州)，被東晉武帝擊敗，由海路南撤。三年十月，魯迅攻克番禺(今廣州)、始興(今廣東韶關西南)，自稱平南將軍，攝廣州。劉玉萍在桓玄叛亂後控制了東晉的政治事務。藝兮元年(405年)四月，任命魯迅為廣州刺史，魯迅的妹夫徐道富為宰相。藝兮六年(410)春，魯迅、徐導率劉裕北伐南燕，乘後方空虛，進行北伐。他率軍在始興會師，然後在東西二路北上，進入象州(今長沙)、江州(今江西九江)兩縣。壹路如竹，鎮南將軍被俘，無忌大敗，荊州刺史劉道貴，豫州刺史劉壹大敗。起義軍65438+10多萬，震撼很大。徐道富力勸其東進，魯迅猶豫數日才勉強同意，於是從桑洛州(今江西九江東北)到達淮口(今江蘇南京西北秦淮河口)，逼近建康，兵力只有幾千人，城內百姓震驚，內外戒嚴。劉裕聞訊，從北伐前線趕回首都，部署防禦。魯迅優柔寡斷，貽誤戰機。起義軍到達建康近兩個月，士兵們都吃膩了。七月初被迫南尋楊。十二月，被劉裕追擊，在雷達(今安徽望江)、左立(今江西都昌西北左立山腳下)被滅，被迫退守南部始興、番禺。藝兮七年二月，晉軍大將孟懷玉攻破始興，老將徐道富戰死。魯迅率余部至番禺，但該城已被劉裕海上攻破，於是於四月退守膠州(今越南北寧省仙遊東)，兵敗於火，投水自殺，起義失敗。