1794年，圖恩伯格首次發表了西瓜的名稱lanatus，但他將其歸入苦瓜屬，因此未能識別。
1834-1838年，施拉德第壹次把西瓜歸為壹個屬，給了西瓜。該名稱被1954年召開的第七屆國際植物學大會認為是合法的，並被采用至今(《國際植物學命名法》，附件III，1958)。同時，石還確定了西瓜的名稱，藥用西瓜的名稱，以及另外兩個品種西瓜(非洲野生西瓜)和西瓜的名稱
在1838-1884中，Spach和Schweinfurt Voelter發表了藥用西瓜C. Colocyntis var。埃及綠洲種植的芋頭。
1866年，植物學家阿勒菲爾德。提出西瓜種子的分類。但他的分類並沒有被後人所用，因為他只是簡要地記錄了壹些變種，而沒有揭示它們之間的關系。
1901年Rane根據西瓜果實的顏色和形狀建立了北美西瓜品種的明確分類，但從現代的觀點來看，分類的種類應該是壹個品種群。Karen的分類也未能得到認可，因為它只使用了北美有限的材料。
在1924中，Cognault (A.Cogniax)和Harms (Harms)將西瓜屬分為四種:普通西瓜、大西瓜、硬西瓜和無節西瓜，其中前兩種采用了Schneider的分類，後兩種是新的建議，從而為現代西瓜的分類奠定了基礎。
在1930中，貝利將普通西瓜分為普通西瓜下的兩個品種:多毛西瓜品種var.lanatus和飼料西瓜品種var.citroides。但他沒有把可食用的西瓜分開，所以不完整。1930年，潘加洛分食用西瓜和飼料西瓜。
1959年，曼斯菲爾德發表了新的學名Cirtullus lanatus(Thunb。)Mansf。取代施耐德的C.vulgaris，糾正桑德伯格的錯誤。原因是施耐德的名字vulgaris不能容納普通西瓜的野生品種和類型，桑伯格的名字lanatus不正確。從此，西瓜子的正確學名沿用至今。同時，曼斯菲爾德還在西瓜種下劃分了三個品種:var.lanatus、var.caffer和var.citroides，第壹個品種壹般是指生長在南部非洲的野生西瓜，第二個品種是指在Cafre種植並食用的甜西瓜，第三個品種是指飼料西瓜。但問題出在第二個品種上，因為Cafre西瓜產於南部非洲，微甜，多為野生，與食用西瓜在世界上分布廣泛，形態非常多樣，顏色鮮艷，味道香甜有很大不同。因此，曼恩的分類並沒有被完全接受。
1969年，分類學科學(第18卷，第3期)的H.H .寫了《西瓜物種的正確預訂名人》壹文，提出早在1920年，日本的Matsum和Nakai就按照優先規則使用了C.lanatus這個名字，Mansf應該被排序。
1972年期間，蘇聯學者T . B.Ф ypca對蘇聯作物栽培研究所(Bи P)從世界各地收集的2400多個西瓜樣本進行了深入研究，建立了C. lanatus下的亞種，即西瓜亞種ssp.lanatus、普通西瓜亞種ssp.vulgaris和粘籽西瓜亞種ssp。在這些亞種下，又劃分出7個品種，即咖啡西瓜變種、好望角西瓜變種、食物西瓜變種(以上屬於多毛西瓜亞種)、普通西瓜變種、科爾多凡西瓜變種(以上屬於普通西瓜亞種)、粘籽西瓜變種和塞內加爾西瓜變種。此外，還建立了藥用西瓜的兩個亞種，即野生藥用西瓜亞種狹口西瓜亞種和溫和藥用西瓜亞種無斑西瓜亞種。Forsa對西瓜的分類是當今世界上最全面的分類體系，結合了前人的研究成果，掌握了大量的第壹手樣本數據。
在1985中，林德培等人將中國特有的種子西瓜(古阿古阿)歸為變種var.megalaspermus，屬於普通西瓜亞種，從而將福柯的西瓜歸為4種5亞種8變種。