隨著我國改革開放和經濟建設的深入發展，北京口岸出入境邊防檢查業務量大幅度增長，口岸走私與反走私、控制與反控制的鬥爭日趨復雜和激烈。牢記重要戰略機遇期公安機關的三大政治責任和社會責任，北京邊檢站黨委帶領全警堅決貫徹黨的路線方針政策和部局黨委的指示決議，牢固樹立首都意識、出國意識、改革意識， 努力增強維護國家安全和政治穩定、服務經濟社會發展的能力，形成了“團結、堅定、勤政、務實”的優良學風，為改革開放和經濟建設做出了積極貢獻。
自2007年全國邊檢工作會議以來，北京邊檢站堅決貫徹部局黨委要求，堅持著力提升邊檢服務水平，堅持提高通關效率，堅持從嚴把關，大力推進服務理念、業務素質、職業素養“三支柱”建設，努力樹立“文明國家之窗”的良好形象。各項工作不斷取得新的進展，贏得了社會各界的廣泛贊譽。
中華人民共和國北京出入境邊防檢查站是公安部直屬的副局級單位，直屬公安部出入境管理局領導。下設辦公室、政治部、監察部、後勤部、業務部、技術部，下轄北京西站出入境邊防檢查站、四個邊防檢查隊、1遣返檢查所等基層單位。
北京出入境邊防檢查機關成立於5月，1951。在過去的50年裏，它經歷了許多管理制度的變化。1998根據國務院批復精神，北京邊檢站由現役制改為專業制，成立北京出入境邊防檢查站。無論管理體制如何變化，北京出入境邊防檢查站的職責從未改變。依法對北京口岸出入境人員及其行李物品、交通工具及其所載貨物實施邊防檢查，監控出入境交通工具，守衛口岸禁區，維護出入境秩序，執行主管機關委托和其他法律法規規定的任務。
在全面建設小康社會的新時期，北京出入境邊防檢查站堅持以建設“文明國家之窗”為目標，堅持“規範管理、嚴明紀律、文明執勤、依法行政”，圓滿完成了黨和國家領導人出訪、外國政府首腦訪華、第十壹屆亞運會、聯合國第四次世界婦女大會、中非合作北京峰會等重大活動的出入境邊防檢查任務。為維護國家主權、安全和正常出入境秩序作出了重要貢獻，隊伍中湧現出全國優秀人民警察、北京市文明標兵、新長征突擊隊等壹大批先進典型。2005年，在全球航空運輸協會組織的服務質量評比中，北京出入境邊防檢查站被譽為提升機場整體服務質量的“領軍”單位。