耶魯大學歷史悠久。當時康涅狄格州立法機關於6月9日1701通過了《自由建立大學學院法案》，建立了新的大學學院，學院的目的是培養新壹代的導師和* * *。很快，十個公理會成員，由詹姆斯皮彭，在康涅狄格州布蘭福德舉行會議，並收集他們的書籍，形成了學院的第壹個圖書館。這些人也是哈佛大學的校友。
該學院最初名為“學院學校”，位於其第壹任總統亞伯拉罕·皮爾遜的家鄉，也就是現在康涅狄格州的克林頓市。大學畢業後，他搬到了康涅狄格州的老賽布魯克，然後搬到了韋瑟斯菲爾德，最後在1718搬到了現在的紐黑文所在地。
與此同時，哈佛第六任校長，因為增加馬瑟與學校其他神職人員的不和，馬瑟的治理方式被批評為過於自由，教規過於寬松，教學制度過於粗糙。這種敵對關系導致馬瑟轉而支持新成立的學院，希望它能實現他認為最正統的清教思想。
1718年，在殖民首領的指示下，因克裏斯·馬瑟之子科頓·馬瑟與在威爾士發展良好的商人埃利胡·耶魯聯系，祈求資金援助，擴建新成立的學院。最後，在當時的第壹重要人物傑裏邁亞·杜默(Jeremiah Dummer)的勸說下，在印度貿易中獲得大量財富的英國東印度公司總裁，終於同意捐贈9包貨物和417冊書籍，以及英國國王喬治壹世的掃描畫像。那些貨物後來換來了560英鎊，這在當時是壹筆非常大的財產。科頓·馬瑟(Cotton Mather)建議將學院名稱改為“耶魯學院”，以表達對埃利胡·耶魯的感謝，並希望埃利胡·耶魯通過此舉進行更多捐贈。
普林斯頓大學由黎明長老會創建，最初是為了培養長老而建立的。起初，學校位於新澤西州伊麗莎白鎮，校長是喬納森·迪金森。原來的校名是新澤西學院(有人提議用當時的州長喬納森·貝爾的名字來命名，但被否決了)。新澤西學院的第二任校長是老亞倫·伯爾，第三任是喬納森·愛德華茲。1756年，新澤西學院遷至普林斯頓。