水上飛行法的具體目的是:
去除雜質，清洗藥物。去除水溶性雜質和水不溶性可漂浮雜質。如朱砂、雄黃。使藥物的質地細膩。通過使用細粉和粗粉在水中的不同懸浮液，將藥物制成極細粉，便於口服和外用，提高了其生物利用度。如朱砂、滑石粉。
防止藥物在研磨時粉塵飛揚，汙染環境。如朱砂、滑石粉。去除藥物中的水溶性有毒物質。如朱砂中的可溶性汞鹽、雄黃中的可溶性砷鹽。
操作方法:
將藥物適當粉碎，放入研缽或其他合適的容器中，加入適量的水，研磨成糊狀，加入大量的水攪拌，粗粉會下沈，立即倒出混懸液，將沈降的粗粒再次研磨，重復操作，直至細粒。
最後丟棄不能懸浮的雜質。將前後倒出的懸浮液混合，靜置。沈澱後，倒掉上面的清水，取沈澱，晾幹，研磨成極細的粉末。適用藥物是壹些不溶於水的礦物藥，如朱砂、珍珠、滑石等，需要特殊的細度，常采用水飛法粉碎。
水飛法的作用:
1，減少氧化:
水飛法在許多方面都有其獨特之處。由於水飛法是在加水的情況下進行研磨，可以減少礦物藥物在研磨過程中的熱變和氧化，防止粉末飛揚。輕的非藥用部分和完全被水溶解的物質可以通過水在粉末上的懸浮而被除去。
2.過濾:
當藥材中含有幾種礦物質時，將其磨成糊狀，然後加水至容器滿，使表面的浮泥刮去，古代稱濁汁；如果壹次只倒出懸浮液的上半部分，較重的可以丟棄或檢驗後丟棄。
3.純度:
這種方法常用於從爐甘石中除去粘土、富含鐵和鉛的部分以及二氧化矽雜質。再比如雄黃，可以用來去除藥材中的部分As2O3。如果增加用水量，礦物組分毒砂或對應於As2O3的毒砂將更多地溶解。