專家回應:家族有獨特的遺傳密碼。
李輝說，男性與他們的父系祖先擁有相同的遺傳密碼，每個家庭都可以找到壹個獨特的SNP(單核苷酸多態性)。在人類的繁衍過程中，Y染色體總是通過世代相傳遺傳下來，後代可以完全繼承父親的Y染色體主幹而不受混血的影響。
焦點二:遠古DNA可以測量嗎？
李輝回應:“樓蘭美人”就是證明。
復旦實驗室有壹個非常先進的古DNA分析室。這項技術成熟於90年代初，國際上已經可以分析研究2萬年以內的骨骼DNA。2007年，李輝的研究小組成功地從壹塊新石器時代的骨頭中提取出Y染色體。早在1980年，湖南醫科大學就從馬王堆漢墓女屍中提取了DNA和RNA。2003年至2005年，考古學家在羅布泊樓蘭墓地發掘的“樓蘭美人”就這樣確定了。
焦點三:壹場炒作壹場作秀？
專家回應:DNA檢測需要考古證據。
李輝等人承認，DNA檢測只是輔助手段，只能證明曹操的骨架是不是曹姓男子，結果需要從歷史和考古的角度相互論證。炒作其實不是壞事，透明度會增加，媒體的監督能力也會增加。韓生認為，如果DNA檢測結果顯示是曹石，並得到墓葬年代、規模、骨架年代等諸多考古和歷史證據的證實，基本可以得出結論。
焦點四:廢話學術研究，忽悠很多錢在上面？
專家回應:人類基因譜系將破解歷史。
李輝說，復旦實驗室參與了基因地理組項目，與全球15頂尖分子人類學實驗室合作，承擔了全球民族家族的研究任務。這就需要在全國範圍內進行大規模的抽樣，從頭到尾對不同姓氏的代表性人群進行分析。所以，曹操墓的DNA驗證只是計劃中的壹小部分。目前科研經費主要來自國際合作項目和復旦大學。在韓生看來，通過這次DNA測試，歷史學家或許可以勾勒出整個曹操家族的遷徙與分布，從中可以獲得對中國人口變遷史的新解讀。
焦點五:曹操本名夏侯，檢測曹的DNA不可行。
專家回應:曹操的父親其實出自曹氏。
韓生解釋說，《三國誌》中並沒有提到曹操是夏侯氏家族，傳說出自曹操的對手吳國仁寫的《曹臧傳》，並不可靠。韓生說，按照當時繼承宗族的基本原則，曹石自然是從自己的宗族中收養。課題組壹開始招募曹姓男子和夏侯姓男子作為誌願者參與DNA檢測。盡管韓生認為從歷史的角度來看曹操不是夏侯的後代，但他說最終的結果取決於李輝的DNA測試。