考古勘探資料證明，該沈船保存完好，水深約27米，船體大部分被泥沙覆蓋。
從露出的艙壁和船體上部的冷凝水來看，古船處於下沈狀態，方向接近南北方向。初步判斷古船長寬不小於25.5米和7米。古船上層建築已不存在，但艙壁和船舷完好。由於船體表面覆蓋著泥沙和塊狀冷凝物，船體和文物受腐蝕和人為因素的破壞較小。初步判斷，除船體中部有兩三個船艙外，沈船其他部分及船艙內貨物保存完好。
據水下考古人員初步研究，沈船上散布的貨物長約28米，寬10米，裝載的瓷器至少有10000件，甚至多達6萬件。初步推斷沈船年代為明代萬歷年間，船上文物主要為明代粵東或閩南、江西民間瓷窯生產的青花瓷。沈船“南澳壹號”保存完好，船體大部分被泥沙覆蓋。從露出的艙壁和船體上部的冷凝水來看，古船處於下沈狀態，方向接近南北方向。初步判斷古船長寬不小於25.5米和7米。
據勘測資料顯示，這艘古代沈船上所鋪的貨物長約28米，寬10米。古船上層建築已不存在，但艙室和船舷完好。由於船體表面覆蓋著泥沙和大塊冷凝物，船體和文物受腐蝕和人為因素的破壞較小。初步判斷，除船體中部有兩三個艙室外，沈船其他部位及艙內貨物狀況良好。