根據遊戲原版，日版動畫按時間順序可分為七部:寶可夢、寶可夢超世代、寶可夢鉆石與珍珠、寶可夢超願、寶可夢XY、寶可夢:太陽&月亮、寶可夢征途。
包系列除了電視動畫系列之外，還包括壹些副業作品:周刊包電臺、包星期天、神奇寶貝粉碎等等，講述的都是不是主角的人物故事。
2065438年8月1日起，神奇寶貝公司法人:東京都港區六本木代表處社長石原弘樹將逐步將神奇寶貝更名為寶可夢，同時制作並發布寶可夢的logo設計。
神奇寶貝情節
在未刊出的文章中，新手訓練者小智從達木博士那裏得到了壹只皮卡丘，它不情願且喜怒無常，不喜歡進入精靈球。肖誌離開了家鄉鎮心鎮，開始了官渡地區的征途。
在贏得皮卡丘的信任後，小智開始了認真挑戰世界各地道觀的旅程。旅途中，肖鋼和小霞兩位導師加入了肖誌的寶可夢聯盟。
參加完應時會議後，肖誌受達木博士委托，前往奧蘭群島從內木博士取回GS球，小剛暫時留在內木博士。
旅途中，小智加入了橙盟，並結識了寶可夢觀察員肖劍。和他壹起旅行回到鎮心鎮後，達木博士看不懂GS球怎麽開，就留下肖劍做助手，派小智、小霞、小剛去了市區，把GS球交給了鬼皮鎮的鋼鐵先生，然後參加了寶可夢聯賽-城市聯賽的白銀大會。