但清軍剛入關時，他們的行為極其野蠻霸氣。尤其是在州縣統壹的時候，發生了殘酷的屠殺。比較重要的事件是揚州十日遊和嘉定三屠夫。揚州大屠殺是指清兵進攻揚州造成的重大傷亡。所以清軍大將杜鐸在成功占領揚州後，下令大將屠城、燒殺、搶劫，不做虧心事。屠殺持續了許多天。大屠殺之後，血流成河，屍體散落在田野裏。據統計，約有80萬人在這場大屠殺中喪生。
清軍在中原建立了清朝。清兵為了實行滿清制度，頒布了壹道政令，就是剃頭，命令江南軍民壹律剃頭，否則格殺勿論。這是漢人無法忍受的。這不僅違反傳統，也是極大的羞辱。於是當地官民起義，引起動亂，嘉定很快被占領。然而，這座城市的人民無法逃脫清軍將領李成棟的炮擊，嘉定很快被收復。然後李成棟下令屠殺這座城市。壹天之內，3萬人被殺。這是這個城市的第壹次大屠殺。
此後不久，反清勢力重新占領嘉定，於是李成棟命令他的部下鎮壓嘉定郊區。這是第二次大屠殺。不久，吳造反，收復嘉定城。接著，李成棟怒氣沖沖地沖進嘉定，開始了第三次大屠殺。兩萬人在這場大屠殺中喪生。這是嘉定三圖。揚州十大屠殺和嘉定三大屠殺都是清兵鎮壓起義者和平民的大屠殺，暴露了清兵殘忍殺戮的嗜血本性和犯罪手段。