清朝鹹豐年間，寺廟被毀。光緒末年，住持覺郎和尚集資重修大雄寶殿。抗日戰爭，又毀了。1946年，方丈吳真多方奔走，籌集重建資金。解放後，只有六間僧房，逐漸廢棄。
1997經省、市人民政府批準，高淳縣人民政府聘請安徽省青陽縣九華山僧人申徽大師主持寺廟修復工作，更名為真如寺，並有中國佛教協會原會長趙樸初題寫的匾額。
真的很像禪宗寺廟所在的遊子山。相傳春秋時期，孔子周遊列國時登上此山，故名。遊子山前臨寧萬高速，後臨土水古城湖，左接烏頭楚尾古城，右接西漢丞相隱居的漆橋。地勢遼闊，形似龍戲珠，清新幽靜，山上松柏叢生。真如禪寺就坐落在這塊風水寶地上。