牛頓後來出版了《數學原理》，這不僅為牛頓個人贏得了巨大的聲譽，對胡克也是壹個不小的打擊。胡克認為他對科學的貢獻沒有被世人接受，沒有取得相應的成果，這多少有些不公平。於是他在日記中寫道，牛頓得罪牛頓是因為他只關心眼前利益，沒有良心話。在英國皇家學會的壹次演講中，他認為牛頓竊取了自己關於引力本質的研究成果，但沒有人關註胡克。這讓胡克非常沮喪，越來越懷疑。
後來，虎克因病去世。當時牛頓是皇家學會的新任會長，他提議將學會遷到新的地方。在搬遷過程中，虎克的許多有價值的儀器和理論著作丟失了，包括虎克的畫像。當時因為虎克的長相比較醜，不喜歡拍照，也就意味著當時在學動的路上丟失的畫像是虎克唯壹的畫像。它的丟失使得後人無法了解胡克的真實長相。沒人知道這幅畫像是意外丟失還是牛頓濫用私權處理的。
那時候科學剛剛誕生，有學術之爭很正常。經常發生的是誰發現了誰就早早出名。雖然牛頓發明了萬有引力定律，但胡克顯然在他之前發表了很多相關論文。至於牛頓抄襲，只有當事人知道。