崆峒山上有很多寺廟。山麓問宮殿，建於唐朝以前。唐代，軒轅宮依山而建(清代遷天仙宮)。北宋幹德年間(963-968)，在主峰馬宗山山頂創立真武堂。鄭和年間(111─11118)，宋徽宗頒布法令，在山腳下重建溫溫宮。明朝嘉靖二十年(1541)，平涼漢番皇室將馬宗山峰修成皇城，在皇城內重修真武殿，鋪上鐵瓦，遠看如玉殿，並增建了祭殿、藥王殿、老君樓、太和樓、玉皇閣、靈官。從山下到香山梁頂，先後修建了聚賢橋、王牧宮、紫霄宮、老營宮、於震宮、南雅宮、天仙宮、鬥姆宮、靜樂宮、玄聖宮、飛仙閣、墨真寺、十二帥殿、白虎殿、東華殿、混元樓。盛蕾山頂建有嫘祖殿、玉皇樓、聖母院和三官殿。中泰至皇城建三天門，二天門建三交洞。在此期間，重建了溫溫宮，並在院內增加了全真閣。據清乾隆《甘肅通誌》卷十二記載，崆峒山主要寺廟有軒轅宮、老君宮、南延宮、從樂宮、王牧宮、溫溫宮。另壹卷，載:宋，全真道道士，遊崆峒山，著書立說。清康熙年間(1662─1722)，陜西隴縣龍門洞道士苗青陽應邀將崆峒山變成道教十方叢林。此後，皇城前建鐘鼓樓二層，雷聖峰周圍建三星殿、龍軍殿、遠景殿，香山梁頂建三清道祖殿，朝天門之上建王耀洞，東臺建關勝帝君殿，中臺建飛聖宮、黃三樓，趙賀殿建三清殿、文昌宮。民國時期，在南臺建立了秋祖廟，在中臺建立了奇真寺，在鳳凰嶺建立了太清宮，在燭峰建立了八仙殿，在棋盤嶺建立了三座寺廟。
1958之後，大部分道士被迫離開寺廟，建築逐漸衰落。到1980，只剩下皇城建築群、紫霄宮和雷祖殿，其余都是廢墟或瓦礫場。1982後，群眾集資重建雷生峰建築群，維修改造皇城部分建築，將原黃愚館改造為五館。到1989年，溫溫宮、王牧宮相繼重建，建有天仙宮、太清宮、黃三樓、三廟、少年宮、軒轅樓。
崆峒旅遊網:kongtongtour/中國道教協會主編:《道教大辭典》(北京:華夏出版社1994)，第871頁。