1927年，由於財政困難，工人罷工，醫院業務停止，醫院董事會無力支撐，自動申請當時的市政府接手。在此之前壹年，市政府已經在市區建立了壹所“復性醫院”，並於1927年3月1日接管了艾慧醫院。兩家醫院分別更名為市第壹和第二精神病醫院，第壹家醫院被批準容納260名病人和1至2名醫生；第二家醫院獲準容納400名病人，包括兩名醫生。
1935年6月，當時的廣州市政府決定收購艾慧醫院的所有原有財產，包括第二醫院和培英中學。65438+同年2月26日，第壹精神病院被撤銷，兩家醫院合並重組，第壹醫院的病人和公物移至第二醫院接收，並更名為市精神病療養院。入住醫生人數評定為800人，醫生4人，男女護士1人，男女護士32人，全院醫生、護士、工人、警察、護士。占地40余畝，與解放初期基本持平。這是解放前精神病院最繁榮的時期。
1937年7月抗戰爆發，1938年10月廣州淪陷。國民黨廣州政府倉促撤走前，將精神病院委托給廣州天主教會保管。天主教會從加拿大和其他國家派遣了三名修女來負責醫院的工作。沒有專職醫生，只有十多個男女護士，十多個工人和行李員。天主教代管七年多，直到抗戰勝利。這期間資金來源幾近斷絕，僅靠少量捐款和患者自費勉強維持，非常困難。職工的生活也很艱難，死了很多病人，住院病人急劇下降，從抗戰勝利時的800多人下降到只有60多人。由於抗戰時期沒有記錄，現在無法給出更詳細的描述。
1946年初，國民黨廣州市政府正式收回醫院，自行經營。1946臨時收治精神病人300人。1948的4月份，住院人數達到380人，1949的9月份，下降到近300人。當時醫院除了院長和醫務主任，還有4名醫生，10多名男女護士，60多名員工。1949年廣州解放，同年12年市軍委派人接管精神病院。