防治鼠害應堅持預防為主的原則。壹旦發生，常常是毀滅性的危害，尤其是各種鼠害來勢兇猛，往往在很短時間內造成無法挽救的損失，而且壹般較害蟲的防治困難。所以做好鼠情調查十分重要。調查鼠情發生密度及種類兩方面的內容，以便針對不同鼠種的特性和食性采取相應的防治方法。同時，還要註意菇棚、菇畦周圍草場上的鼠害分布狀況，以及半人工栽培草場臨近山坡、牧場、荒地上鼠害發生的情況，以防範害鼠的遷入與危害。具體防治措施如下：
1.清理環境 創造良好的生態環境，預防害鼠遷入。建造菇棚或菇畦，應遠離居民區、倉庫、暗水溝及樹林等易潛藏害鼠的場地，建棚後徹底清理菇棚附近的石堆、草垛等。舊棚應在進料前堵除鼠洞，提前防治。
2.毒餌誘殺 這是常用的有效措施。常用毒殺鼠類的藥劑如下：
（1）安妥 化學名稱為1-萘基硫脲，也稱α-萘基硫脲。分子式：C11H10N2S。白色晶體，工業品為灰色或灰褐色粉末，幾乎不溶於水，在陽光和空氣中穩定。對鼠類毒性大，能引起肺水腫而死亡，對挪威大鼠的致毒劑量為6～8毫克/千克。在灰樹花生產上，常制成毒餌誘殺。使用時要註意畜、禽安全。
（2）大隆 化學名稱：3-（3-對溴聯苯基）-1，2，3，4-四氫萘基-4羥基香豆素。為黃白色結晶粉末，熔點228～232℃，不溶於水和石油醚，溶於有機溶劑。急性毒力很強，對鼠類具有選擇性毒力，對其他動物安全。劑型：0.0025%～0.005%的毒餌。壹般用0.005%的毒餌，壹次投毒，對多種野鼠都有很好的效果。
選用鼠類最喜食的誘餌，拌入適量的殺鼠藥進行誘殺。如大家鼠宜用飯食、蔬菜及肉類做誘餌；沙土鼠選用麥類；莫氏田鼠選用胡蘿蔔、馬鈴薯、蔬菜為宜；鼢鼠選用大蔥、胡蘿蔔效果最佳。其次是根據不同殺鼠藥和鼠種的體型大小確定有效的用藥量。目前市場上出售的殺鼠農藥種類很多，據體型中等的鼠種為例，不同殺鼠農藥的用量如表6-1。
表6-1 常用殺鼠毒餌的用藥量（%）
對體型小的莫氏田鼠，可適當減少用藥量，在毒餌中加3%的磷化鋅即可；對體型大的鼢鼠則需要10%的磷化鋅。拌餌的方法是在鼠種喜吃的糧食中加入壹定量的黏著劑如稀面糊、米湯等，拌均勻後再將鼠藥拌入即可。也可將糧食煮半熟，撈出後趁熱拌入鼠藥。用多汁性蔬菜，如大蔥、胡蘿蔔、馬鈴薯做餌料，均采用生拌法，將餌料切成豆粒大小的塊狀後拌入農藥即可。
使用毒餌誘殺鼠害，必須利用鼠類取食困難的時期，否則因會因鼠食餌少影響毒殺效果。在野外施用餌料選在早春，此時作物尚未播種，牧草也未發芽，誘餌毒鼠的效果最佳。把10～20克餌料投放在鼠類活動覓食的地方或距鼠洞1～2米之內，切忌把餌料投放在鼠洞口或洞內，避免引起鼠類的警覺而拒食。投餌應壹次投足，因鼠類壹次中毒未死，則不再食餌。對常年生活於地下的鼢鼠，須用輔助工具把餌料投入洞內，方可達到誘殺效果。
投餌扡由扡桿、扡把、旋轉式扡筒三部分組成。扡桿鐵制，長1.5米左右，並刻有尺度，借此掌握扡桿的深度。旋轉式扡筒由鐵制的內、外套組成，套筒上有可以旋轉開閉的投餌孔，內筒固定在扡插桿上，外筒套在內筒的外面。使用時，把毒餌裝入扡筒內，插入鼠洞，旋轉把手，使內、外筒的投餌孔重合，讓餌料流入洞內。由於鼢鼠怕光、怕風，為防止其堵洞時把餌料推出洞外，拔出扡筒後立刻用濕土堵嚴扡插孔。
投餌管采用直徑3厘米左右的竹管，鏟除內節，壹端削成舌狀，內套壹根與竹管內徑相吻合可以抽動的木棍。使用時，把木棍插入竹管內，壹起插入鼠洞，再抽出木棍，把餌料順著竹管流入鼠洞內，最後拔出竹管，並用濕土把插孔堵死。
施用毒餌誘殺害鼠，壹定要嚴防人畜中毒。在野外使用毒餌後，嚴禁放牧雞鴨和牲畜。室內、外或菇棚內施用毒餌後，要做後標記，嚴禁玩童入內造成中毒。
3.煙炮熏殺 因鼠類食料充足而撒施毒餌誘殺效果不佳時，可采用煙炮熏殺。先用2～3層廢報紙卷成長10厘米、直徑2.5厘米的紙筒，壹頭折死，裝入煙炮藥料10～15克，在開口的壹端加引火撚和少許火藥後再把口折死備用。
配制煙炮藥是以火藥做燃燒劑，加入幹馬糞末、硫磺和具有熏蒸作用的粉劑型農藥。常用的配方如下：
硫磺粉1.5份，火藥5份，幹馬糞末3.5份。
硫磺粉、殺蟲藥各1份，幹馬糞末3份，火藥5份。
火硝2.5份，殺蟲農藥2份，幹馬糞末5.5份。
使用方法是首先查清鼠洞及其相通的洞口，放炮前除留下壹個洞口放煙霧炮外，必須把其他洞口全部用土封嚴堵死。否則鼠類有可能從其他洞口竄逃。如果洞型較大，可多放1～2只煙霧炮，以確保鼠洞內有足夠的煙霧毒氣，提高殺鼠效果。
4.磷化鋁熏殺 在毒餌誘殺或煙炮熏殺困難的情況下，可采用磷化鋁熏殺。磷化鋁是壹種灰綠色片劑，每片3克，在潮濕空氣中很快分解放出磷化氫毒氣，遇酸反應更強烈。用藥方法像煙霧炮壹樣，摸清洞情並堵好洞口，將磷化鋁片劑送入洞內，隨後灌水並堵好洞口熏殺。
5.人工捕捉 是人們常用且安全有效的方法之壹，如采用鼠夾、地箭、鼠籠、灌水等。防治鼢鼠采用步踩法，根據鼢鼠活動的特點，在有新土堆處，先把洞挖開，並插壹草棍，在距離被挖開洞口的20～25厘米處劃壹踩痕，同時將土鏟薄，距離洞穴5～10厘米。因鼢鼠怕光怕風，會很快推土堵被挖開的洞口，並觸動草棍幌動，此時立刻對準踩痕重腳猛踏，堵死鼢鼠後退洞道，用鐵鍁挖出消滅。