生物傳感器的應用如下：
1、發酵工業各種生物傳感器中，微生物傳感器最適合發酵工業的測定。因為發酵過程中常存在對酶的幹擾物質，並且發酵液往往不是清澈透明的，不適用於光譜等方法測定。而應用微生物傳感器則極有可能消除幹擾，並且不受發酵液混濁程度的限制。同時，由於發酵工業是大規模的生產，微生物傳感器其成本低設備簡單的特點使其具有極大的優勢。
（1）、原材料及代謝產物的測定
微生物傳感器可用於原材料如糖蜜、乙酸等的測定，代謝產物如頭孢黴素、谷氨酸、甲酸、甲烷、醇類、青黴素、乳酸等的測定。測量的原理基本上都是用適合的微生物電極與氧電極組成，利用微生物的同化作用耗氧，通過測量氧電極電流的變化量來測量氧氣的減少量，從而達到測量底物濃度的目的。
在各種原材料中葡萄糖的測定對過程控制尤其重要，用熒光假單胞菌（Psoudomonas fluorescens）代謝消耗葡萄糖的作用，通過氧電極進行檢測，可以估計葡萄糖的濃度。這種微生物電極和葡萄糖酶電極型相比，測定結果是類似的，而微生物電極靈敏度高，重復實用性好，而且不必使用昂貴的葡萄糖酶。
當乙酸用作碳源進行微生物培養時，乙酸含量高於某壹濃度會抑制微生物的生長，因此需要在線測定。用固定化酵母（Trichosporon brassicae），透氣膜和氧電極組成的微生物傳感器可以測定乙酸的濃度。