我國物流企業的組織結構多屬於直線職能式結構，對於市場不能作出快速反應。目前，精益化已成為當今領先企業組織結構調整中的壹個主流趨勢。精益化的組織結構可以節約大量的人、財、物力，全面提高企業生產經營的效率和效益。組織結構精益化從組織上保證精益物流全面、深入地實施創造，能夠為精益物流的實施創造良好的環境。物流企業組織結構精益化可以通過將傳統組織結構扁平化、柔性化改造來完成。
2、作業環節的精益化
精益物流是壹種強調準時化、精確性的管理，它所強調的消除浪費、連續改善是傳統物流企業繼續生存和發展必須具備的根本思想。物流企業實施精益物流，需要通過規範化、信息化、合理化的作業環節不斷謀求成本節約，提高物流作業效率，提升物流企業的管理水平，改變粗放式的物流管理模式。
3、客戶服務的精益化
物流企業要在物流服務市場的激烈競爭中取得優勢，就必須以客戶為中心，充分發揮自身優勢，在運輸、倉儲、配送等服務基礎上不斷創新服務內容，為客戶提供差異化、個性化的精益物流服務。