生態系統穩定性即為生態系統所具有的保持或恢復自身結構和功能相對穩定的能力。
主要通過反饋調節來完成，不同生態系統的自調能力不同。反饋又分為正反饋和負反饋兩種，負反饋對生態系統達到和保持平衡是必不可少的。正負反饋的相互作用和轉化，保證了生態系統可以達到壹定的穩態。
例如，如果草原上的食草動物因為遷入而增加，植物就會因為受到過度啃食而減少。而植物數量減少以後，反過來就會抑制動物的數量，從而保證了草原生態系統中的生產者和消費者之間的平衡。在生態系統中關於正反饋的例子不多，例如，有壹個湖泊受到了汙染，魚類的數量就會因為死亡而減少，魚類死亡的屍體腐爛，又會進壹步加重汙染，引起更多的魚類的死亡。
生態系統自我調節能力
不同生態系統的自我調節能力是不同的，壹個生態系統的物種組成越復雜，結構越穩定，功能越健全，生產能力越高，它的自我調節能力也就越高。因為物種的減少往往使生態系統的生產效率下降，抵抗自然災害、外來物種入侵和其他幹擾的能力下降。
在物種多樣性高的生態系統中，擁有著生態功能相似而對環境反應不同的物種，並以此來保障整個生態系統可以因環境變化而調整自身以維持各項功能的發揮。因此，物種豐富的熱帶雨林生態系統要比物種單壹的農田生態系統的自我調節能力強。