改革開放後有所變化，但本質上沒有變，還是政府主辦大學，管理大學。
南方科技大學這些年壹直在爭取辦學自由，現在終於出現了所謂中國高校第壹部“基本法”！
《新京報》 (記者周亦楣)2011年6月8日報道：
被譽為中國高校第壹部“基本法”的《南方科技大學管理暫行辦法》(下簡稱《辦法》)正式公布。當天，深圳市政府通過最新壹期《政府公報》披露了全文。《辦法》將於今年7月1日起正式實施。
朱清時校長多次提到的“探索建立具有中國特色的現代大學制度”、“教授治學、學術自治”的原則被寫入《辦法》總則。
在治理結構上，《辦法》提出，南方科大將設立理事會、校長、校務委員會和校學術委員會。
其中，理事會是南科大的決策機構。理事會可以聘任或解聘校長、副校長，審定學校章程、財務預決算報告、以及學校的中長期發展規劃等。
校長是南科大的法定代表人，全面主持學校的教學、科研和其他行政管理工作，對理事會負責，執行理事會決議，履行法律、法規、規章及章程規定的其他職責。
理事會由政府代表，南科大校長及管理團隊、教職工等代表和社會知名人士等組成。理事會理事長由深圳市市長或市長委任的人員擔任，理事由市政府聘任。副校長由理事會根據校長提名聘任。
不過，認真閱讀了這個《南方科技大學管理暫行辦法》，
覺得還是無法逃脫如來佛的掌心，這是可以理解的，既然是以政府撥款為主，那誰來管理的問題就不言而喻了。
但其中倡導的學術自由、教授治校，理事會任免校長之類還是有創新意義的，是壹個進步，是壹種嘗試。
雖然說，理事會理事長由深圳市市長或市長委任的人員擔任，理事由市政府聘任！
但畢竟這樣的形式上的進步還是有重要的現實與歷史意義的，值得關註和研究，值得各大學參考學習。