1、減少田埂、地頭荒角、田頭墳地和雜草較多的撂荒地，盡量少留或不留永久性田埂。這些都是該鼠最適棲息地。
2、結合秋灌、秋翻、冬閑整地，破壞該鼠越冬地。黑線倉鼠洞穴壹般在地表下20～40cm。在作物生長季節，結合農時進行灌溉，能淹死或造成黑線倉鼠不宜棲息的環境。
3、勤除草，使雜草不能結籽（狗尾草、豬毛菜等草籽，在沒有糧食作物時，也是該鼠冬儲的食料）；除草不僅對作物生長有利，也能減少鼠的棲息。
4、人工捕挖。當鼠害不嚴重時，註意動員群眾，利用水灌、夾捕、鍬挖鼠倉，均可在局部收到明顯效果。
5、在秋收季節，采用快收、快運、快打場的方法，減少被鼠盜食機會。
6、加強管理，防止草場退化，可減少黑線倉鼠的數量。在具備灌溉條件的草場，配合施肥、淺耕翻、補播等改良措施，可把草原生態系統維持在良性循環狀態，壹般不會發生鼠害。