相同點：易操作，繁殖快、成本低、易於工業化生產。 不同點： 1、大腸桿菌表達系統轉錄信號與酵母系統不同，與核糖體的結合位點不同 2、大腸桿菌中表達不存在翻譯後修飾作用，故對蛋白質產物不能糖基化；酵母菌具有原核細菌無法比擬的真核蛋白翻譯後加工系統。 3、大腸桿菌表達系統由於分泌能力不足，真核蛋白質常形成不溶性的包涵體，表達產物必須在下遊處理過程中經過變性和復性處理才能恢復其生物活性；酵母菌具有真核生物表達系統基因表達調控和蛋白質修飾功能，避免了產物活性低、包涵體變性復性等問題
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