壹個生態系統是否能高效持續發展，在相當程度上取決於其信息的生產量、信息獲取量、信息獲取手段、信息加工與處理能力、信息傳遞與利用效果，以及信息反饋效能；或者說取決於生態系統的信息流狀態。生態系統信息傳遞過程主要由3個基本環節構成：信源的信息產生、信道的信息傳輸和信宿的信息接收。多個信息過程相連就形成生態系統的信息網。當信息在信息網中不斷被轉換和傳遞時，就形成了生態系統的信息流。
(1)生態系統中的自然信息流主要發生在環境與動、植物之間、植物與植物之間、植物與動物之間，以及動物與動物之間。
環境與動、植物的信息關系：天體運行引起的日照時間長短、月亮和恒星的位置、地球的磁場和重力等的變化，都是生物感應的重要信息，分別可以成為植物生殖發育的信號、候鳥飛行方向的信號和植物生長方向的信號。實驗表明：萵苣種子在波長600～900納米紅光(R)下發芽率很高，而在波長720～780納米的遠紅外光(FR)下幾乎不發芽。
植物與植物間的信息聯系。研究表明植物與植物之間有豐富的信息聯系。例如甘蔗、玉米、棉花能分泌壹種含兩個內酯的萜類化合物——獨腳金酚，只要其他條件合適，濃度在1×10-6摩/升就能促進寄生植物黃獨腳金50％的種子發芽。寄生向日葵、蠶豆和煙草的向日葵列當也有類似的情況。沒有寄主的信息，寄生植物的種子在土壤中10年也不喪失發芽力，只要壹獲得寄主植物的化學信息就迅速發芽。
植物與動物之間的信息聯系：植物的花通過其色、香、味來吸引傳粉昆蟲。植物的果實則通過其色、香、味來吸引傳播種子的鳥類。研究表明，植物的花為粉紅色、紫色和藍色時吸引較多的蜜蜂和黃蜂，黃花吸引較多的蠅類和甲蟲，白花能吸引不少夜間活動的蛾類，紅花則吸引較多的蝴蝶。
動物與動物之間的信息聯系：動物的信息發送和接收的機制更完備，物理、化學和生物信號都可以在動物間傳遞。領域性動物，如雄豹，常在領域邊緣用自己的尿作為警告同類不要侵犯的信息。有幾百種昆蟲可以向體外分泌性信息素，異性同種昆蟲接受到數個信息分子，就可以產生反應，並追蹤到信源，進行交配繁殖。此外，動物通過無聲的身體語言和有聲的發聲器官語言來表達各種意圖。例如，蜜蜂的“舞蹈”語言。當采了花粉的工蜂在蜂巢上面“跳舞”，其他個體在這個工蜂的後面采集有關方向和距離的信息，了解蜜源信息，然後直飛蜜源。當蜜源在附近，蜜蜂跳舞的軌跡是圓形；當蜜源的位置在100米以外，蜜蜂舞蹈的軌跡是第壹個半圓+直線+第二個半圓。蜜蜂用擺尾頻率作距離信號，擺動頻率越慢蜜源距離越遠。舞蹈直線軌跡與地球磁力線的夾角等於蜜源與太陽的夾角，為蜜源方向提供信息。
(2)生態系統中的人工信息流主要包括人類模仿自然、用於控制生物的信息和人類采集並供人類分析判斷的信息。
人工模仿自然信息：利用人工光源或暗室控制日照長度的變化，從而達到控制植物花期的方法已經在花卉生產和作物育種中廣泛應用。利用人工合成的昆蟲體外性激素已經成功應用到害蟲預測預報、迷惑昆蟲和誘捕害蟲等。如果人類能更深入了解自然信息流機制，並適當加以利用，就壹定可以起到事半功倍的作用。
人工采集和生成的信息：為了更好地了解生態系統的狀況，提出適當的調整措施，傳統的方法是肉眼直接觀察和收獲信息，用頭腦加工信息和用口頭直接傳遞信息。例如，人類的經驗、失敗和教訓，都可以作為判斷事物和做事的依據，除了自己外，還可以把情況和判斷告訴別人。隨著科學的發展，先進的方法是用自動或半自動設備采集信息，用計算機加工信息，並用專用信息傳輸渠道準確地傳送到遠近不同的用戶。例如，用我國研制的“風雲”2號衛星自動采集南海臺風生成信息，經過計算機表明其未來可能登陸範圍和時間，並通過電視系統傳到千家萬戶。