流式細胞術工作原理是在細胞分子水平上通過單克隆抗體對單個細胞或其他生物粒子進行多參數、快速的定量分析。它可以高速分析上萬個細胞，並能同時從壹個細胞中測得多個參數，具有速度快、精度高、準確性好的優點，是當代最先進的細胞定量分析技術之壹。
光源、液流通路、信號檢測傳輸和數據的分析系統是流式細胞儀的主要組成。臨床中運用流式細胞儀進行外周血白細胞、骨髓細胞以及腫瘤細胞等的檢測是臨床檢測的重要組成部分。
流式細胞技術（flow cytometry，FCM）是利用流式細胞儀進行的壹種單細胞定量分析和分選技術。流式細胞術是單克隆抗體及免疫細胞化學技術、激光和電子計算機科學等高度發展及綜合利用的高技術產物。
基本結構：流式細胞儀由三部分構成：液流系統，包括流動室和液流驅動系統；光學系統，包括激發光源和光束收集系統；
電子系統，包括光電轉換器和數據處理系統。流式細胞儀的工作原理是使懸浮在液體中分散的經熒光標記的細胞或微粒逐個通過樣品池，同時由熒光探測器捕獲熒光信號並轉換成分別代表前向散射角、側向散射角和不同熒光強度的電脈沖信號，經計算機處理形成相應的點圖，直方圖和加三維結構圖像進行分析。
用於FCM的樣本是單細胞懸液，可以是血液、懸浮細胞培養液、各種體液、新鮮實體瘤的單細胞懸液以及石蠟包埋組織的單細胞懸液等。