《叛逆者》分集劇情如下：
1-10集劇情：1936年，復興社上海區站長陳默群得到了中***地下黨員王誌的線索，啟用最高級別保密行動實施抓捕，卻發現王誌在抓捕前的關鍵時刻脫身。
陳默群懷疑抓捕行動泄密，是因為復興社內部藏有地下黨潛伏人員，懷疑壹切的他遂前往南京，從幹部特訓班中挑選了心懷報國熱誠和堅毅品質的學員林楠笙，協助他搜尋藏身在上海區內的那個中***潛伏者。
11-20集劇情：林楠笙前往面見陳默群，告訴他忠義救國軍駐上海總聯絡站已在他被抓捕時，被日本人炸毀，重慶方面也收到了消息。
陳默群知道自己遭到陷害，變節之事坐實，不可能再回軍統了。與此同時，王世安收到重慶方面回復，要求立刻裁決陳默群。闖入房間，企圖殺死陳默群，陳默群跳窗逃跑，林楠笙緊追不舍，要求他隨自己回去解釋清楚。但陳默群自知無望，朝追來的顧慎言開槍後逃跑。
21-30集劇情：林楠笙查到壹名日偽的接線員，當初正是他接聽了舉報陳默群行蹤的那通電話，林楠笙逼問對方，當晚都聽到了什麽，接線員坦白，那晚打電話的人，聲音跟王世安十分相像。
林楠笙壹時情急，將接線員帶回站裏與王世安對質，不料王世安竟以除掉漢奸叛徒的名義，將對方壹槍擊斃。林楠笙後悔於自己的沖動，不僅沒有抓住泄密者，還失去了來之不易的知情人。顧慎言寬慰他壹切都要往前看，日後行事壹定要更加小心謹慎。
31-40集劇情：左秋明與林楠笙見面，要他盡快分析壹批從日軍獲取的情報，同時，他發現林楠笙的狀態相較過去有了重大的變化。
左秋明坦誠的與林楠笙說起兵民是勝利之本的觀點，兩人在探討中堅定了中國必勝、日本必敗的信念。林楠笙每晚都在收音機前收聽來自延安的廣播，這是他在香港的苦悶生活中唯壹的光亮。軍統的壹名情報員被日本人抓捕，供出了左秋明。
41-43集劇情：孟安南正在樓下給王世安打電話報信，林楠笙拿出手表質問，孟安南承認自己就是國民黨。兩人發生打鬥，孟安南最終被櫃臺的玻璃碎片劃破喉嚨身亡。
朱怡貞自責於沒有及時發現孟安南的真實身份，導致紀中原犧牲，發報請求黨組織的處分。林楠笙和朱怡貞被警察包圍，兩人從後窗逃跑，被趕來的王世安發現並追捕。
劇集評價
《叛逆者》的人物群像多元且鮮活。深刻的人物形象，糾葛復雜的人物關系和命運走向，為該劇營造出壹種孤獨、悲愴但又飽含希望的美學情調。值得壹提的是，作為故事的核心人物，林楠笙並沒有戴上“主角光環”，而是在走上正確道路的過程中經歷了迷茫、痛苦與掙紮，最終才得到了成長。
該劇在保證諜戰應有的緊湊劇情、驚險場面之同時，著重渲染人物隱忍焦灼的真實心理狀態。利用環境色調，場景道具構圖等，暗示人物所面臨的壓力、沖擊與思考。冷峻鏡頭與細膩情感對撞強烈，更凸顯劇中人物濃厚的革命浪漫主義色彩，以及人物為詩意信仰負重前行的孤高氣質。