流傳千年的媽祖文化風俗習慣在本劇中得到了大量的展示。福建湄洲島是其發源地，媽祖文化的內核有熱愛祖國、熱愛和平、除暴安良、見義勇為、助人為樂、無私無畏、甘於奉獻等，在華人中得到了廣為流傳，單是臺灣地區大小媽祖廟800多座。劇中趙雪蓮扮演的秀湄醫科畢業後，為了向更多的人宣傳普及媽祖文化，毅然選擇了在普通人看來社會地位不及醫生的導遊職業，劉漢強扮演的臺灣青年陳永吉被海浪裹挾漂流到湄洲島，被湄洲島姑娘秀湄的舅舅救起，在秀湄照料他的過程中，兩人產生了戀情。該劇層層推進，講述了兩岸三代人悲歡離合的故事，劇情跌宕起伏，演員挑選得當。湄洲島上秀美的風景以及源遠流長的媽祖文化都為該劇增添了極強的可看性。
故事梗概
《湄洲島奇緣》講述的是臺灣光復後的壹九四六年，在海南某碼頭，當年被日軍擄到海南做苦力的臺灣勞工林誌雄帶著身懷六甲的妻子阿清終於登上了臺灣“安祥號”輪船返鄉。天有不測風雲，“安祥號”在返鄉途中失去動力，老天爺拋棄了這條滿載勞工的舊船。禍不單行，屋漏又逢連陰雨，阿清就要生產了。阿清終於生下了林海安、林海祥壹對可愛的雙胞胎。分離在即，林誌雄夫婦把親生兒子林海祥留在了湄洲島上。帶著難舍的情緣，離開了湄洲返回臺灣。從此數十年，隔海想望，兩地相思。五十多年後，隨臺灣媽祖信徒進香團到湄洲島媽祖祖廟進香攝影，尋親的林永吉（林海安之子）失足落水被湄洲姑娘楊秀湄所救。在時間飛馳的日子裏，永吉秀湄他們默默地相愛了。老天造化弄人，永吉的母親無意中發現秀湄是永吉的堂妹，為怕日後悲劇發生，於是斷然阻止孩子們之間的繼續交往。痛苦欲絕的秀湄，心冷徹骨的永吉。“山窮水復疑無路，柳暗花明又壹村。”秀湄的父親講述了壹個藏在內心深處離奇而又讓人心動的往事。