圖書館大樓面積29880平方米，閱覽座位2430個，館內設有：流通書庫，書、刊閱覽室，電子閱覽室，影視視聽室，醫學科技查新室和24小時自助圖書室等服務部門；現有紙質圖書99.16萬冊（圖書32萬余種），中、外文期刊4000多種（現刊1537種）；擁有CNKI、VIP、PML等中、外文圖書、期刊數據庫18個，電子圖書86.13萬冊 。
該館從1992年開始使用計算機進行管理。 2002年起采用先進的SULCMIS圖書自動化集成管理系統，實現了紙質圖書采訪、編目、文獻流通、圖書入藏、信息檢索查詢、電子閱覽、視頻點播、多媒體播放、文獻傳遞等各項業務的現代化管理。圖書館網站創建於2001年，並不斷更新、升級、完善。通過圖書館網站，讀者既可以查看新書推薦、書刊預約、續借、催還等互動性服務項目，也可以全天24小時訪問該館訂閱的全部中、外文電子文獻資源，為讀者提供了便捷的、全天侯的中、外文期刊全文、題錄文摘以及電子圖書的查詢、瀏覽和下載服務。
在完成傳統的外借、閱覽等基本文獻服務的同時，圖書館註重教育職能和情報職能的發揮。該館從1984年起開設《醫學信息檢索與利用》課程，是廣西最早承擔高校醫學文獻檢索課程教學任務的高校館之壹。1994年獲得廣西壯族自治區科技查新資格，開展醫學科技查新服務。堅持開展新生入館教育工作，使新生讀者能及時、全面地了解圖書館的性質和職能，掌握利用圖書館的基本技能和方法；積極開展讀者培訓講座、參考咨詢等服務，幫助讀者更好地利用圖書館資源。為了更好地滿足廣大讀者的需求，該館還與區內、外各圖書館之間建立了館際互借關系，豐富館藏。該館是全國高等學校醫藥圖書館協會委員館、CALIS華南地區成員館、CALIS醫學成員館、廣西高等教育學會圖書館專業委員會常務理事館。